مشخصات پژوهش

عنوان	تجزیه و تحلیل مجموعه های ژنی جهت شناسایی ژن ها و مسیرهای زیستی مرتبط با صفات وزن بدن در مرغ
نوع پژوهش	مقاله چاپ‌شده
کلیدواژه‌ها	ژن کاندیدا، وزن بدن، آنالیز بر پایه مسیر، مرغ
چکیده	این پژوهش به منظور مطالعه پویش کل ژنوم بر پایه تجزیه و تحلیل غنی سازی مجموعه ژنی جهت شناسایی جایگاه های ژنی مؤثر بر وزن بدن در سنین مختلف چهار نژاد مرغ چوآ، سیلک، لنگشن و بیرد با استفاده از آرایه های ژنومی با تراکم بالا بوده است. اطلاعات رکوردهای فنوتیپی و ژنوتیپی نمونه ها از پایگاه ذخیره ژنومی برخط Frontiersin استفاده شد. مطالعه پویش کل ژنومی از 402 قطعه مرغ و خروس با صفات وزن بدن از هفته اول تا 15 هفتگی در برنامه GenABEL ارزیابی شد. در مرحله بعد آنالیز غنی سازی مجموعه ژنی با بسته نرم افزاری goseq برنامه R با هدف شناسایی عملکرد بیولوژیکی ژن های نزدیک در مناطق انتخابی کاندیدا از طریق پایگاه های GO، KEGG، DAVID و PANTHER انجام گردید. در این پژوهش تعداد 10 نشانگر تک نوکلئوتیدی واقع روی کروموزوم های 1، 2، 5، 7، 10، 14، 18، 19، 20 و 27 شناسایی شدند که با ژن-های ABCG1، MYOD1، MYH10، MYH11، MYO1B، MYO1C، MYO1E، MYL1، MYL2، MYL3، SLC2A8، ACACA، ACOX1، ACOX2 و PNPLA2 مرتبط بودند. برخی از این ژن ها در مناطق معنی دار با مطالعه قبلی هم خوانی داشت. در آنالیز غنی سازی، مجموعه ژنی تعداد 17 مسیر هستی شناسی ژنی و بیوشیمیایی با صفات وزن بدن شناسایی شد (P˂0.01). از این بین، مسیرهای cytoskeletal protein binding،anatomical structure development و Tricarboxylic acid cycle نقش مهمی در توسعه فیبرهای عضلانی اسکلتی و متابولیسم چربی داشتند. با توجه به تأیید مناطق قبلی پویش ژنومی صفات وزن بدن و شناسایی مناطق ژنومی جدید، استفاده از یافته های این تحقیق می تواند باعث تسریع در پیشرفت ژنتیکی برنامه های اصلاح نژادی مرغ شود.
پژوهشگران	حسینعلی قاسمی (نفر پنجم)، ایمان حاج خدادادی (نفر چهارم)، محمد حسین مرادی (نفر سوم)، حسین محمدی (نفر دوم)، امیر حسین خلت آبادی فراهانی (نفر اول)