مشخصات پژوهش

صفحه نخست /پویش ژنومی صفات بیومتری در بز ...
عنوان پویش ژنومی صفات بیومتری در بز با استفاده از روش‌های بیزی
نوع پژوهش مقاله ارائه‌شده
کلیدواژه‌ها پویش ژنومی، واریانس ژنتیکی، ژن کاندیدا، بز
چکیده هدف از انجام پژوهش حاضر، مطالعه پویش ژنومی با استفاده از روش‌های چند مرحله‌ای بیزی BayesA، BayesB و BayesCπ برای صفات مرتبط با ساختار بدن در برخی از نژادهای بز بود که با تراشه‌های 50K بز تعیین ژنوتیپ شدند. برای هر دام، پنج صفت شامل ارتفاع قد از جدوگاه، دور سینه، طول بدن، عمق سینه و طول استخوان شرمگاهی رکورد جمع آوری شده بود و با استفاده از بسته نرم افزاری hibayes در محیط R میزان اثر هر یک SNPها برآورد گردید. میزان واریانس ژنتیکی توجیه شده در روش BayesA نسبت به سایر روش‌ها بیشتر برآورد گردید. مناطق ژنومی با بیشترین واریانس ژنتیکی روی کروموزوم‌های 1، 4، 5، 6، 10، 11، 16 و 27 قرار داشتند. ژن‌های شناسایی شده عملکرد‌های مهمی را در ارتباط با سنتز کلاژن، فرآیند استخوان-سازی، رشد عضلات اسکلتی و تنظیم یون کلسیم بر عهده داشتند. نتایج تحقیق حاضر نشان می‌دهد هنگامی که معماری صفات بررسی شده از مدل تعداد زیاد جایگاه ژنی پیروی کند، معمولاً روش‌ BayesA بر بیزهای با انتخاب متغیر ارجحیت دارند.
پژوهشگران علیرضا علیخانی (نفر چهارم)، محمد حسین مرادی (نفر سوم)، امیر حسین خلت آبادی فراهانی (نفر دوم)، حسین محمدی (نفر اول)