مشخصات پژوهش

عنوان	مطالعه پویش کل ژنوم بر پایه غنی سازی مجموعه های ژنی صفات مهم اقتصادی در بلدرچین ژاپنی
نوع پژوهش	مقاله چاپ‌شده
کلیدواژه‌ها	افزایش وزن بدن، بلدرچین ژاپنی، پویش ژنوم، خوراک مصرفی، ضریب تبدیل خوراک
چکیده	در این پژوهش، به منظور شناسایی ژن‌ها و مسیرهای مرتبط با برخی صفات اقتصادی، مطالعه پویش کل ژنوم بر مبنای آنالیز غنی‌سازی مجموعه‌های ژنی با استفاده از یک تراشه SNP ژنوم بلدرچین ژاپنی (‌Illumina iSelect 4K) در یک جمعیت F2 حاصل از تلاقی دوطرفه انجام شد. به ازای هر پرنده، صفات شامل میزان خوراک مصرفی، افزایش وزن بدن، ضریب تبدیل خوراک، خاکستر استخوان درشت‌نی و پا اندازه‌گیری شد. با استفاده از نرم‌افزار GCTA و براساس مدل خطی مختلط ارتباط هر یک SNP‌ها با هر یک از صفات بررسی شد. آنالیز غنی‌سازی مجموعه‌های ژنی با بسته نرم‌افزاری goseq برنامه R با هدف شناسایی طبقات عملکردی و مسیرهای زیستی ژن‌های نزدیک در مناطق ژنومی کاندیدا انجام شد و در نهایت برای آنالیز بیوانفورماتیکی از طریق پایگاه‌های برخط DAVID و PANTHER استفاده گردید. در این پژوهش تعداد 11 نشانگر تک نوکلئوتیدی واقع روی کروموزوم‌های 2، 3، 4، 5، 10، 18، 20، 24 و 27 شناسایی شدند که با ژن‌های NPY، DRD2، PTPRN2، BMPR1B، MYF5، IGF2BP1، MYO1E، FGF2، LDB2، BMP4، ACOX1، PCK1، PLCB4، PLCB1 و PLCG1 مرتبط بودند. در آنالیز غنی‌سازی مجموعه ژنی تعداد 23 طبقات هستی شناسی و مسیرهای بیوشیمیایی KEGG با صفات مورد بررسی شناسایی شد (P˂0.05). از این بین طبقات هستی‌شناسی Protein glycosylation، Myoblast differentiation،Positive regulation of muscle cell differentiation ، مسیرهای بیوشیمیایی MAPK signaling pathway وCalcium signaling pathway نقش مهمی در توسعه فیبرهای عضلانی اسکلتی، مصرف خوراک و قابلیت جذب داشتند. با توجه به تأیید مناطق قبلی پویش ژنومی و شناسایی مناطق ژنومی جدید، استفاده از یافته‌های این پژوهش می‌تواند در انتخاب ژنتیکی با هدف بهبود تولید، مفید باشد.
پژوهشگران	محمد حسین مرادی (نفر سوم)، امیر حسین خلت آبادی فراهانی (نفر دوم)، حسین محمدی (نفر اول)