مشخصات پژوهش

عنوان	مطالعه پویش کل ژنوم و آنالیز مسیرهای زیستی برای شناسایی ژن های موثر بر رنگ پوشش در گوسفندان لری-بختیاری
نوع پژوهش	مقاله چاپ‌شده
کلیدواژه‌ها	پویش ژنومی، مسیرهای زیستی، رنگ پوشش، گوسفند
چکیده	رنگ پوشش یکی از صفات مهم اقتصادی در گوسفند بوده و همچنین می تواند در شناسایی و تعیین خصوصیات نژادی مورد استفاده قرار گیرد. هدف پژوهش حاضر، مطالعه پویش کل ژنوم و آنالیز مسیرهای زیستی بر مبنای تجزیه و تحلیل غنی سازی مجموعه ژنی جهت شناسایی جایگاه ها و ژن های مرتبط با صفت رنگ پوشش گوسفندان لری-بختیاری بود. پویش کل ژنوم براساس روش مورد-شاهدی در برنامه PLINK نسخه 90/1 انجام شد. آنالیز غنی سازی مجموعه ژنی با بسته نرم افزاری goseq برنامه R نسخه 1/6/3 با هدف شناسایی سطوح عملکردی و مسیرهای زیستی ژن های نزدیک در مناطق انتخابی کاندیدا انجام شد و در نهایت برای آنالیز بیوانفورماتیکی از پایگاه های برخط GO، Metacyc، KEGG، Reactome و Panther استفاده گردید. در این پژوهش نشانگر تک نوکلئوتیدی معنی دار روی کروموزوم های 1، 2، 6، 9، 10 و 16 شناسایی شدند که با ژن های EDNRB، PDGFRA، TCF25 و TYRP1 مرتبط بودند. در آنالیز غنی سازی مجموعه ژنی تعداد 5 مسیر هستی شناسی ژنی با صفت رنگ پوشش مرتبط بودند (P˂0.05). از این بین، مسیرهای Regulation of protein tyrosine kinase activity، Regulation of protein kinase A signaling وActivation of protein kinase activity نقش مهمی در رشد و توسعه ملانوسیت ها و تنظیم رنگدانه ها در بدن داشتند. با توجه به تأیید ارتباط برخی از مناطق ژنومی شناسایی شده در تحقیق حاضر با رنگ پوشش در گوسفند و سایر گونه های دیگر و همچنین شناسایی مناطق ژنومی جدید، ژن های شناسایی شده در این مطالعه می توانند به عنوان ژنهای کاندیدا برای مطالعات تکمیلی و نهایتا در انتخاب ژنتیکی رنگ پوشش در گوسفند مورد استفاده قرار گیرد.
پژوهشگران	امیر حسین خلت آبادی فراهانی (نفر سوم)، محمد حسین مرادی (نفر دوم)، حسین محمدی (نفر اول)