مشخصات پژوهش

عنوان	مطالعه پویش کل ژنوم بر پایه مدل هاپلوتیپ و تجزیه و تحلیل غنی سازی مجموعه های ژنی مرتبط با سن اولین زایش در گاو نلور
نوع پژوهش	مقاله چاپ‌شده
کلیدواژه‌ها	تجزیه و تحلیل غنی سازی، هاپلوتیپ، صفت تولید مثل، گاو، مسیرهای زیستی
چکیده	هدف از این پژوهش، بررسی صفت سن اولین گوساله زایی به عنوان یک صفت تولید مثلی مهم بود. بدین منظور از رکوردهای فنوتیپی در گاوهای نلور برای مطالعه پویش ژنوم بر پایه تجزیه و تحلیل غنی سازی جهت شناسایی سازوکار های زیستی استفاده شد. ارزیابی پویش کل ژنوم با بسته نرم افزاری GHap بر پایه مدل هاپلوتیپی در برنامه R انجام شد. تجزیه غنی سازی مجموعه های ژنی با بسته نرم افزاری goseq برنامه R با هدف شناسایی طبقات عملکردی و مسیرهای زیستی ژن های نزدیک در مناطق ژنومی کاندیدا انجام شد و در نهایت برای تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی از طریق پایگاه های GO، KEGG، DAVID و PANTHER استفاده شد. با تجزیه و تحلیل غنی سازی مجموعه های ژنی، مسیرهای هستی شناسی و )ژن های کاندیدای( Estrogen metabolic process (HSD17B12)، Synapse organization (KIRREL3 و PPFIA2)، Sensory perception of mechanical stimulus (MYO3A و KCNMA1)، Protein tyrosine kinase activity (IGF1R)، cell-cell junction (FRMD4A)، GnRH signaling pathway (ADCY5) و Focal adhesion (PPP1R12A) شناسایی شدند. ژن های کاندیدا نقش مهمی در باروری، سن اولین گوساله زایی، بیوسنتز استروژن، نرخ آبستنی تلیسه ها، رشد ابتدایی جنین، سن بلوغ و تنظیم هموستازی گلوکز در تخمدان داشتند. با توجه به تأیید مناطق قبلی پویش ژنومی و شناسایی مناطق ژنومی جدید، استفاده از یافته های این پژوهش می تواند در انتخاب ژنتیکی گاو مفید باشد.
پژوهشگران	محمد حسین مرادی (نفر سوم)، امیر حسین خلت آبادی فراهانی (نفر دوم)، حسین محمدی (نفر اول)