مشخصات پژوهش

عنوان	مطالعه پویش کامل ژنوم با تجزیه و تحلیل غنی سازی مجموعه های ژنی برای شناسایی ژن ها و مسیرهای مرتبط با خلق و خوی در گاو براهمن
نوع پژوهش	مقاله چاپ‌شده
کلیدواژه‌ها	آرایه ژنومی، بوس ایندکیوس، رفتار، ژن کاندیدا، هستی شناسی ژن
چکیده	درک کنترل ژنتیکی خلق و خوی به عنوان یک صفت پیچیده و دارای همبستگی با صفات اقتصادی یکی از اهداف اصلاح نژادی در صنعت گاو گوشتی است. هدف پژوهش حاضر، مطالعه پویش کل ژنوم بر مبنای تجزیه و تحلیل غنی سازی مجموعه ژنی جهت شناسایی جایگاه های ژنی مؤثر بر صفات مرتبط با خلق و خوی گاو نژاد براهمن بود. بدین منظور از اطلاعات ژنوتیپی 1370 رأس گاو براهمن و رکوردهای فنوتیپی شامل سرعت خروج، امتیاز پن و امتیاز خلق و خوی استفاده گردید. ارزیابی پویش کامل ژنوم با PLINK نسخه 90/1 انجام شد. تجزیه و تحلیل غنی سازی مجموعه های ژنی بوسیله بسته نرم افزاری goseq برنامه R با هدف شناسایی مسیرهای زیستی ژن های نزدیک در مناطق انتخابی کاندیدا انجام شد. در نهایت تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی از پایگاه های برخط GO، Metacyc، KEGG، Reactome و Panther استفاده گردید. با تجزیه و تحلیل غنی سازی مجموعه های ژنی، مسیرهای بیوشیمیایی و )ژن های کاندیدای( neurotransmitter secretion (NRXN3 و CACNG3)، Cycle Dopamine Neurotransmitter Release (PPFIA2)، regulation of neuron projection development (GRID2)، neuron projection (SLC8A1 و KCNQ2)، Axonal growth inhibition (RTN4R)، Neurotrophin signaling pathway (MAP2K2، MAP3K5 و PSEN1) و Focal adhesion (TLN2) مرتبط با سرعت خروج شناسایی شدند. ژن های کاندیدا شناسایی شده نقش مهمی در تفرق و تمایز سیناپس ها، انتقال دهنده های عصبی، بیماری های عصبی و اختلال روانی، استرس های اکسیداتیو و محیطی، گیرنده های هورمونی و هموستازی گلوکز داشتند. با توجه به تأیید مناطق قبلی پویش ژنومی و شناسایی مناطق ژنومی جدید، استفاده از یافته های این پژوهش می تواند در انتخاب ژنتیکی حیوانات با تولید بالاتر از طریق دام های آرام مفید باشد.
پژوهشگران	ابوذر نجفی (نفر چهارم)، محمد حسین مرادی (نفر سوم)، امیر حسین خلت آبادی فراهانی (نفر دوم)، حسین محمدی (نفر اول)