|
عنوان
|
شناسایی مناطق ژنومی کاندیدای مرتبط با ذخیره چربی بر پایه روش hapFLK در نژادهای گوسفند دنیا
|
|
نوع پژوهش
|
مقاله ارائه‌شده
|
|
کلیدواژه‌ها
|
پویش ژنوم، نشانه های انتخاب، روش hapFLK، چربی، گوسفند
|
|
چکیده
|
هدف از پژوهش حاضر، پویش کل ژنوم جهت شناسایی مناطق کاندیدای مرتبط با ذخیره چربی در برخی از نژادهای گوسفند دنیا به روش hapFLK بود. برای این منظور، از اطلاعات ژنوتیپی منتشر شده در پروژه HapMap و سایر مقاله های معتبر دربرگیرنده 20 نژاد گوسفند دنبه دار و بدون دنبه در سرتاسر دنیا استفاده شد. پس از استخراج اطلاعات ژنوتیپی از منابع مختلف، ابتدا ساختار جمعیتی دام های مورد مطالعه از طریق آنالیز مؤلفه های اصلی (PCA) بررسی شد. نتایج حاصل نشان داد که تمام حیوانات در گروه نژادی خود قرار می گیرند و حیوانات دنبه دار و بدون دنبه بر روی مؤلفه اصلی اول (PC1) از همدیگر تفکیک می شوند. سپس نشانه های انتخاب بین نژادهای دنبه دار و بدون دنبه با استفاده از روش آماری hapFLK مورد بررسی قرار گرفت. نتایج حاصل نشان دهنده وجود پنج منطقه ژنومی کاندیدا برای این صفت روی کروموزوم 2، 3، 7، 11 و 12 می باشد. مطالعات هستی شناسی و همچنین بررسی عملکرد ژن های گزارش شده در این مناطق ژنومی نشان داد که بیشتر ژن های شناسایی شده در این مناطق در مسیرهایی دخالت دارند که به صورت مستقیم یا غیر مستقیم با متابولیسم چربی، سازگاری با شرایط محیطی و سیستم ایمنی در ارتباط هستند. در مجموع، نتایج این تحقیق می تواند اطلاعات ارزشمندی در زمینه شناسایی مناطق ژنومی مؤثر بر صفت ذخیره چربی در گوسفند فراهم آورد.
|
|
پژوهشگران
|
حسین محمدی (نفر چهارم)، امیر حسین خلت آبادی فراهانی (نفر سوم)، فاطمه جیریایی (نفر دوم)، محمد حسین مرادی (نفر اول)
|