امیر حسین خلت آبادی فراهانی

امروزه به منظور بهرهگیری از نتایج مطالعات مرتبط با مطالعات پویش کل ژنومی ( )GWASو استفاده از آن در جهت ترسیم شبکههای تنظیم ژنی، مطالعات جدیدی در حال انجام میباشد که مبنای آن استفاده از الگوریتمهای ماتریس AWMمیباشد. در مطالعه حاضر، برای ترسیم شبکههای ژنی از طریق الگوریتمهای ماتریس PCIT -AWMو ارتباط پلیمورفیسمهای تک نوکلئوتیدی ) (SNPبهصورت جداگانه با فنوتیپهای تولید و ترکیبات شیر گوسفند نسبت داده شد و نواحی ژنومی برای شناسایی ژنهای کدکننده پروتئینی که در مجاور SNPقرارداشتند، تعیین شدند. برای این منظور از دادههای تکراری صفات تولید و ترکیبات شیر گوسفند Valle del Beliceپس از کنترل کیفی، 964راس میش و SNP 82773استفاده شد و دادههای فنوتیپی شامل 8836رکورد روز آزمایش برای 6صفت تولید شیر (مقدار تولید ، میزان و درصد چربی، میزان و درصد پروتئین و تعداد سلولهای سوماتیکی شیر بود. نتایج نشان داد که با استفاده از الگوریتمهای ماتریس PCIT-AWMاز بین ژنهای کاندیدای شناسایی شده، که در ارتباط مستقیم و غیرمستقیم با صفات مرتبط با ،DPY30 ،ITSN2 ،CDH23 ،DDX25 ، BAZ1A ،VGLL4 ، ERBB4 ،OSBPL3 تولید شیر بودند ژنهای FAT3و CAPN10شناسایی شدند و شبکه تنظیم ژنی آنها با استفاده از برنامه cytoscapeرسم شد. همچنین نتایج نشان داد که از بین 01ژن شناسایی شده، ژن DDX25ارتباط بیشتری با ژنهای دیگر دارد. نتایج مطالعه حاضر و سایر مطالعات نشان داد که فرآیند پیچیده تولید و ترکیبات شیر تحت تاثیر شبکه تنظیم ژنی بیش از 01ژن مهم و ارتباط با تعداد زیادی از ژنهای دیگرقرار دارد و احتمالا برای انجام کارهای اصلاح نژادی میتوان از این شبکه ژنی استفاده کرد