حسین محمدی

امروزه به‌منظور بهره‌گیری از نتایج تحقیقات مرتبط با مطالعات پویش کل ژنومی (GWAS) و استفاده از آن در جهت ترسیم شبکه‌های تنظیم ژنی، مطالعات جدیدی در حال انجام می‌باشد که مبنای آن استفاده از الگوریتم‌های ماتریس AWM است. در مطالعه حاضر، برای ترسیم شبکه‌های ژنی از طریق الگوریتم‌های ماتریسAWM -PCIT و ارتباط SNPها با فنوتیپ‌های تولید و ترکیبات شیر گوسفند استفاده شد. برای این منظور از داده‌های تولید و ترکیبات شیر مربوط به‌469 رأس میش نژاد Valle del Belice و از اطلاعات ژنوتیپی مربوط به‌37228 نشانگر SNP استفاده شد. داده‌های فنوتیپی شامل 5586 رکورد روز آزمایش برای 6 صفت تولید شیر (مقدار تولید، میزان و درصد چربی، میزان و درصد پروتئین و تعداد سلول‌های بدنی شیر) بود و شبکه تنظیم ژنی آن‌ها با استفاده از برنامه cytoscape رسم شد. نتایج نشان داد که با استفاده از الگوریتم‌های ماتریس AWM-PCIT از بین ژن‌های کاندیدای شناسایی شده، که در ارتباط مستقیم و غیرمستقیم با صفات مرتبط با تولید شیر بودند ژن‌های OSBPL3، ERBB4، VGLL4، BAZ1A، DDX25، CDH23، ITSN2، DPY30، FAT3 و CAPN10 شناسایی شدند. همچنین نتایج نشان داد که از بین 10 ژن شناسایی شده، ژن DDX25 ارتباط بیشتری با ژن‌های دیگر دارد. نتایج مطالعه حاضر و سایر مطالعات نشان داد که فرآیند پیچیده تولید و ترکیبات شیر تحت تأثیر شبکه تنظیم ژنی بیش از 10 ژن مهم و ارتباط با تعداد زیادی از ژن‌های دیگرقرار دارد و با توجه به تأیید نتایج حاصل از مطالعه قبلی در زمینه‌ی پویش ژنومی صفات تولید و ترکیبات شیر، و شناسایی مناطق ژنومی جدید مرتبط با این صفات، استفاده از یافته‌های این تحقیق، می‌تواند در انتخاب ژنتیکی گوسفند مفید باشد