1403/08/13
امیر حسین خلت آبادی فراهانی

امیر حسین خلت آبادی فراهانی

مرتبه علمی: دانشیار
ارکید: https://orcid.org/0000-0001-5805-590X
تحصیلات: دکترای تخصصی
اسکاپوس: 44661391600
دانشکده: دانشکده کشاورزی و محیط زیست
نشانی: دانشگاه اراک، گروه علوم دامی
تلفن:

مشخصات پژوهش

عنوان
مطالعه پویش ژنومی مرتبط با تولید و ترکیبات شیر گوسفند بر پایه آنالیز غنی سازی مجموعه های ژنی
نوع پژوهش
مقاله ارائه‌شده
کلیدواژه‌ها
پویش ژنومی، تولید شیر، امتیاز سلول های بدنی، آنالیز غنی سازی، گوسفند
سال 1401
پژوهشگران امیر حسین خلت آبادی فراهانی ، زینب علیپور ، محمد حسین مرادی ، حسین محمدی

چکیده

هدف پژوهش حاضر، مطالعه پویش کل ژنوم بر مبنای تجزیه و تحلیل غنیسازی مجموعه ژنی جهت شناسایی جایگاههای ژنی و مسیرهای بیوشمیایی مؤثر بر صفات مرتبط با تولید شیر، ترکیبات شیر و امتیاز سلولهای بدنی در گوسفند نژاد وال دل بلیک بود. به این منظور اطلاعات ژنوتیپی 476رأس گوسفند این نژاد به همراه رکوردهای فنوتیپی مرتبط با صفات تولیدی شامل تولید شیر، درصد چربی، مقدار چربی، درصد پروتئین، مقدار پروتئین و امتیاز سلولهای بدنی برنامه PLINKنسخه ( )1/90ارزیابی شد. پس از انجام مراحل مختلف کنترل کیفیت، نهایتا 42285نشانگر SNPدر 426حیوان برای آنالیزهای نهایی مورد استفاده قرار گرفتند. در مرحله بعد آنالیز غنیسازی ژنی و بیوانفورماتیکی با هدف شناسایی عملکرد بیولوژیکی ژنهای نزدیک در مناطق انتخابی کاندیدا از طریق پایگاههای برخط هستی شناسی انجام گردید. نتایج آنالیز بر پایه غنیسازی مجموعههای ژنی منجر به شناسایی مسیرهای (ژن کاندیدای) فسفوریلاسیون چربی (ژن کاندیدای ،)TTC7Bجابجایی لیپوپروتئین (ژن ،)ZDHHC17 تنظیم انتقال یون کلسیم (ژن )ATP2B2و مسیر فرآوری هورمون پپتید (ژن )PCSK6در ارتباط با تولید شیر، مسیر تنظیم فرایندهای متابولیکی اسید چرب (ژن IRS1و )SLC45A3مرتبط با چربی شیر، مسیر انتقال سیگنال توسط فسفوریلاسیون پروتئین (ژن )ERCC6و مسیر فرایند متابولیکی اسید آمینههای گوگرددار (ژن )NOX4در ارتباط با پروتئین شیر و نهایتاً مسیرهای تنظیم مثبت پاسخ به محرکهای بیوتیک (ژن ،)PRKCAمسیر پاسخ به محرکهای خارجی (ژن ،)CACNA2D1 تنظیم پاسخ به استرس (ژنهای EGFRو )HSP90B1و مسیر پاسخ به عفونتهای باکتریایی(ژن کاندید )ANXA3در ارتباط با امتیاز سلوهای بدنی شیر شد. استفاده از یافتههای این تحقیق میتواند باعث تسریع در پیشرفت ژنتیکی برنامههای اصلاح نژادی گوسفندان شیری شود.