1403/08/13
امیر حسین خلت آبادی فراهانی

امیر حسین خلت آبادی فراهانی

مرتبه علمی: دانشیار
ارکید: https://orcid.org/0000-0001-5805-590X
تحصیلات: دکترای تخصصی
اسکاپوس: 44661391600
دانشکده: دانشکده کشاورزی و محیط زیست
نشانی: دانشگاه اراک، گروه علوم دامی
تلفن:

مشخصات پژوهش

عنوان
شناسایی مناطق ژنومی کاندیدای مرتبط با ذخیره چربی بر پایه روش hapFLK در نژادهای گوسفند دنیا
نوع پژوهش
مقاله ارائه‌شده
کلیدواژه‌ها
پویش ژنوم، نشانه های انتخاب، روش hapFLK، چربی، گوسفند
سال 1400
پژوهشگران محمد حسین مرادی ، فاطمه جیریایی ، امیر حسین خلت آبادی فراهانی ، حسین محمدی

چکیده

هدف از پژوهش حاضر، پویش کل ژنوم جهت شناسایی مناطق کاندیدای مرتبط با ذخیره چربی در برخی از نژادهای گوسفند دنیا به روش hapFLK بود. برای این منظور، از اطلاعات ژنوتیپی منتشر شده در پروژه HapMap و سایر مقاله های معتبر دربرگیرنده 20 نژاد گوسفند دنبه دار و بدون دنبه در سرتاسر دنیا استفاده شد. پس از استخراج اطلاعات ژنوتیپی از منابع مختلف، ابتدا ساختار جمعیتی دام های مورد مطالعه از طریق آنالیز مؤلفه های اصلی (PCA) بررسی شد. نتایج حاصل نشان داد که تمام حیوانات در گروه نژادی خود قرار می گیرند و حیوانات دنبه دار و بدون دنبه بر روی مؤلفه اصلی اول (PC1) از همدیگر تفکیک می شوند. سپس نشانه های انتخاب بین نژادهای دنبه دار و بدون دنبه با استفاده از روش آماری hapFLK مورد بررسی قرار گرفت. نتایج حاصل نشان دهنده وجود پنج منطقه ژنومی کاندیدا برای این صفت روی کروموزوم 2، 3، 7، 11 و 12 می باشد. مطالعات هستی شناسی و همچنین بررسی عملکرد ژن های گزارش شده در این مناطق ژنومی نشان داد که بیشتر ژن های شناسایی شده در این مناطق در مسیرهایی دخالت دارند که به صورت مستقیم یا غیر مستقیم با متابولیسم چربی، سازگاری با شرایط محیطی و سیستم ایمنی در ارتباط هستند. در مجموع، نتایج این تحقیق می تواند اطلاعات ارزشمندی در زمینه شناسایی مناطق ژنومی مؤثر بر صفت ذخیره چربی در گوسفند فراهم آورد.