حسین محمدی

درک کنترل ژنتیکی خلق و خوی به عنوان یک صفت پیچیده و دارای همبستگی با صفات اقتصادی یکی از اهداف اصلاح نژادی در صنعت گاو گوشتی است. هدف پژوهش حاضر، مطالعه پویش کل ژنوم بر مبنای تجزیه و تحلیل غنی سازی مجموعه ژنی جهت شناسایی جایگاه های ژنی مؤثر بر صفات مرتبط با خلق و خوی گاو نژاد براهمن بود. بدین منظور از اطلاعات ژنوتیپی 1370 رأس گاو براهمن و رکوردهای فنوتیپی شامل سرعت خروج، امتیاز پن و امتیاز خلق و خوی استفاده گردید. ارزیابی پویش کامل ژنوم با PLINK نسخه 90/1 انجام شد. تجزیه و تحلیل غنی سازی مجموعه های ژنی بوسیله بسته نرم افزاری goseq برنامه R با هدف شناسایی مسیرهای زیستی ژن های نزدیک در مناطق انتخابی کاندیدا انجام شد. در نهایت تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی از پایگاه های برخط GO، Metacyc، KEGG، Reactome و Panther استفاده گردید. با تجزیه و تحلیل غنی سازی مجموعه های ژنی، مسیرهای بیوشیمیایی و )ژن های کاندیدای( neurotransmitter secretion (NRXN3 و CACNG3)، Cycle Dopamine Neurotransmitter Release (PPFIA2)، regulation of neuron projection development (GRID2)، neuron projection (SLC8A1 و KCNQ2)، Axonal growth inhibition (RTN4R)، Neurotrophin signaling pathway (MAP2K2، MAP3K5 و PSEN1) و Focal adhesion (TLN2) مرتبط با سرعت خروج شناسایی شدند. ژن های کاندیدا شناسایی شده نقش مهمی در تفرق و تمایز سیناپس ها، انتقال دهنده های عصبی، بیماری های عصبی و اختلال روانی، استرس های اکسیداتیو و محیطی، گیرنده های هورمونی و هموستازی گلوکز داشتند. با توجه به تأیید مناطق قبلی پویش ژنومی و شناسایی مناطق ژنومی جدید، استفاده از یافته های این پژوهش می تواند در انتخاب ژنتیکی حیوانات با تولید بالاتر از طریق دام های آرام مفید باشد.