1403/02/21
امیر حسین خلت آبادی فراهانی

امیر حسین خلت آبادی فراهانی

مرتبه علمی: دانشیار
ارکید: https://orcid.org/0000-0001-5805-590X
تحصیلات: دکترای تخصصی
اسکاپوس: 44661391600
دانشکده: دانشکده کشاورزی و محیط زیست
نشانی: دانشگاه اراک، گروه علوم دامی
تلفن:

مشخصات پژوهش

عنوان
مطالعه پویش کل ژنومی برپایه آنالیز مسیر مرتبط با صفات ساختاری در اسب
نوع پژوهش
مقاله ارائه‌شده
کلیدواژه‌ها
اسب، ژن کاندیدا، نشانگر تک نوکلئوتیدی، صفات تیپ
سال 1401
پژوهشگران امیر حسین خلت آبادی فراهانی ، مهسا نظری ، محمد حسین مرادی ، حسین محمدی

چکیده

نژادهای اسب در طی انتخاب طبیعی و مصنوعی، دچار تحول مطلوب زیستی شدهاند. این امر منجر به تنوع زیادی در بین نژادهای مختلف شده است که در بسیاری از صفات فنوتیپی مانند اندازه بدن، ترکیب عضله، سرعت دوندگی و نوع کارکرد با یکدیگر متفاوت هستند. پژوهش حاضر بهمنظور مطالعه پویش ژنومی بر مبنای تجزیه و تحلیل غنیسازی مجموعه ژنی جهت شناسایی جایگاههای ژنی مؤثر بر برخی صفات مسابقهای و غیر مسابقهای اسب انجام شده است. اطلاعات رکوردهای فنوتیپی و ژنوتیپی نمونهها از پایگاه ذخیره ژنومی Animal genomeبرداشته شده است. مطالعه پویش ژنومی از 814رأس اسب با صفات ارتفاع، وزن، استقامت و سرعت در برنامه PLINKارزیابی شد. سپس، آنالیز غنیسازی مجموعه ژنی با هدف شناسایی عملکرد بیولوژیکی ژنهای نزدیک در مناطق انتخابی کاندیدا از طریق پایگاههای DAVID ،KEGG ،GOو PANTHERانجام گردید. در این پژوهش 2082نشانگر تک نوکلئوتیدی شناسایی شد که از این تعداد، بیشترین نشانگر ( )179واقع در کروموزوم 1و کمترین نشانگر ( )16واقع در کروموزوم 12شناسایی شدند که با ژنهای ،GH1 ،CACNA1D ،TBX5 ،ADRA2B ،LMCD1 مرتبط بودند. درBMP وIGF1R ،WNT10B ،ATP2B1 ،ERBB4 ،ADCY ،PLCG1 ،PLCB1 ،SIX4 ،MYF5 آنالیز غنیسازی مجموعه ژنی تعداد 10مسیر هستیشناسی ژنی و بیوشیمیایی با صفات اندازه بدن و استقامت شناسایی شد ( .)P > 0/01از بین این مسیرها، مسیرهای بیوشیمیایی تنظیم رشد بافت عضلانی، مسیر سیگنال دهی کلسیم، پاسخ سلولی به ترکیبات حاوی اکسیژن، تنظیم اندازه ساختار آناتومی ارتباط مستقیمی با رشد و عملکرد ورزشی داشتند. ژنهای شناسایی شده در این پژوهش میتوانند درک روشنی از پایه مولکولی مربوط به صفات اندازه بدن و عملکرد ورزشی در اسب ایجاد نمایند. نتایج حاصل از این پژوهش میتواند دیدگاه جدیدی در رابطه با معماری ژنتیکی صفات در برنامههای اصلاح نژادی اسب ایجاد نماید.