1403/02/21
امیر حسین خلت آبادی فراهانی

امیر حسین خلت آبادی فراهانی

مرتبه علمی: دانشیار
ارکید: https://orcid.org/0000-0001-5805-590X
تحصیلات: دکترای تخصصی
اسکاپوس: 44661391600
دانشکده: دانشکده کشاورزی و محیط زیست
نشانی: دانشگاه اراک، گروه علوم دامی
تلفن:

مشخصات پژوهش

عنوان
مطالعه پویش کل ژنومی برای شناسایی ژن های کاندیدا و مسیرهای زیستی مرتبط با تولید و ترکیبات شیر گوسفند بر پایه آنالیز غنی سازی مجموعه های ژنی
نوع پژوهش
پایان نامه های تقاضا محور و غیر تقاضا محور
کلیدواژه‌ها
پویش ژنوم، تولید شیر، امتیاز سلول های بدنی، آنالیز غنی سازی، گوسفند.
سال 1400
پژوهشگران امیر حسین خلت آبادی فراهانی(استاد راهنما)، محمد حسین مرادی(استاد مشاور)، حسین محمدی(استاد مشاور)، زینب علیپور(دانشجو)

چکیده

شناسایی ژن های بزرگ یکی اثر مهم بر صفات اقتصادی یکی از مهم ترین اهداف اصلاح نژادی در پرورش گوسفند است. پژوهش حاضر به منظور مطالعه پویش ژنومی بر مبنای تجزیه و تحلیل غنی سازی مجموعه ژنی جهت شناسایی جایگاه های ژنی موثر بر برخی صفات مرتبط با تولید شیر و امتیاز سلول های بدنی گوسفند بوده است. بدین منظور 476 نمونه گوسفند نژاد valle del belice و رکورد مرتبط با صفات تولیدی شامل تولید شیر، درصد پروتئین، درصد چربی و امتیاز سلول های بدنی در برنامه PLINK ارزیابی شد. به منظور شناسایی اینکه ژن های شناسایی شده در چه مراحل بیولوژیکی درگیر هستند از پایگاه های آنلاین BIOMART و DAVID استفاده شد. در این پژوهش تعداد نه نشانگر تک نوکلئوتیدی واقع بر روی کرومزوم های 1، 6، 7، 10، 14، 21، 25 و 28 شناسایی شدند که برخی از این مناطق ژنومی به طور مستقیم و غیرمستقیم با ژن های مؤثر بر صفات تولید شیر و سلول های سوماتیک هم پوشانی دارند. ژن های کاندیدای PRKCA، ANXA3، EGFR و HSP90B1 با سلول های سوماتیک، PCSK6، TTC7B، ZDHHC17 و ATP2B2 با تولید شیر، ATP2B2، NOX4 و ERCC6 با پروتئین شیر، IRS1 و SLC45A3 با چربی شیر مرتبط، شناسایی شدند. در آنالیز غنی سازی مجموعه ژنی تعداد 20 مسیر هستی شناسی ژنی با صفات تولید و امتیاز سلول های بدنی مرتبط بودند (05/0˂P). از این بین مسیرهای Response to bacterium، Positive regulation of response to biotic و Regulation of response to stress نقش مهمی در سیستم ایمنی مرتبط با امتیاز سلول های بدنی داشتند. همچنین در ارتباط با تولید، چربی و پروتئین شیر مسیر های Lipid phosphorylation، Regulation of calcium ion transport، Regulation of fatty acid metabolic process و Sulfur amino acid metabolic process ارتباط معنی داری داشتند. با توجه به تایید مناطق قبلی پویش ژنومی صفات تولیدی و امتیاز سلول های بدنی، همچنین شناسایی مناطق ژنومی جدید و استفاده از یافته های این تحقیق می تواند باعث تسریع در پیشرفت ژنتیکی برنامه های اصلاح نژادی گوسفند شود.