|
عنوان
|
تجزیه وتحلیل ردپای انتخاب مرتبط با ذخیره چربی دنبه گوسفندان با استفاده از داده های توالی یابی RNA
|
|
نوع پژوهش
|
مقاله ارائه‌شده
|
|
کلیدواژه‌ها
|
گوسفند، مناطق ژنومی، نژاد دنبه دار و بدون دنبه اثر انتخاب، روش FST
|
|
چکیده
|
حدود 9000سال پیش در خاورمیانه، گوسفند به عنوان نخستین دام اهلی شد و بر اساس فرآیندهای انتخاب تکاملی، به دو گروه اصلی نژادهای دنبه دار و بدون دنبه تقسیم گردید. درک سازوکارهای ژنتیکی در ذخیره چربی در گوسفندان دنبهدار در دامداری به روش مدرن بسیار مهم است. پیشرفتها در فناوریهای توالییابی با توان بالا، شناسایی مناطق ژنومی تحت تأثیر اثر انتخاب در نژادهای مختلف گوسفند با استفاده از دادههای توالییابی RNAرا ممکن ساخته است. در این پژوهش، با استفاده از 45نمونه از دادههای RNA-Seqمربوط به هفت مطالعه برای شناسایی SNPها و بررسی اثر انتخاب با روش FSTمورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. یافتههای ما نشاندهنده ظرفیت قابلتوجه دادههای RNA-Seq در شناسایی اثر انتخاب است. تجزیه و تحلیل مؤلفههای اصلی به طور موثر نمونهها را به دو گروه بر اساس نژادهای دنبهدار و بدوندنبه متمایز کرد. به طور ویژه، SNP 877مرتبط با 103ژن در 92منطقه ژنومی به عنوان اثرهای انتخاب شناسایی شدند. تجزیه و تحلیل عملکردی، نقش ژنهای دخیل در اکسیداسیون اسیدهای چرب را در تنظیم ذخیره چربی در دنبه گوسفند آشکار کرد. ژن BMP2به عنوان یک عامل کلیدی انتخاب در طول تکامل گوسفند شناسایی شد که مطابق با یافته های مطالعات قبلی بود.
|
|
پژوهشگران
|
جان مک ایوان (نفر چهارم)، محمد حسین مرادی (نفر سوم)، محمدرضا بختیار زاده (نفر دوم)، حسین عباس آبادی (نفر اول)
|