عنوان
|
بررسی شبکه تنظیمی ژنهای مؤثر در ذخیره چربی در گوسفند با استفاده از نشانههای انتخاب
|
نوع پژوهش
|
مقاله ارائهشده
|
کلیدواژهها
|
ژنهای کاندید، شبکه تنظیم ژنی، گوسفندان آسیایی، گوسفندان آفریقایی، نشانههای انتخاب
|
چکیده
|
امروزه به منظور بهره گیری از نتایج تحقیقات مرتبط با مطالعات نشانههای انتخاب و استفاده از آن در جهت ترسیم شبکه-های تنظیم ژنی، مطالعات جدیدی در حال انجام میباشد. پژوهش حاضر، برای ترسیم شبکههای ژنی از طریق شناسایی مناطق ژنومی، ژنهای کاندید و مسیرهای زیستی مؤثر بر ذخیره چربی در دنبه در برخی از نژادهای گوسفند آسیایی و آفریقایی بر اساس بررسی نشانههای انتخاب و آنالیز غنیسازی مجموعههای ژنی انجام شده است. بدین منظور، از مجموع اطلاعات ژنومی مربوط به 49034 جایگاه نشانگری SNP متعلق به 404 نمونه حیوان شامل 13 نژاد دنبهدار و 7 نژاد بدون دنبه، با ابعاد دنبه و دم نسبتاً مشابه که در مناطق مختلف آسیا و آفریقا پراکنش داشتند، استفاده شد. سپس ژنهای گزارش شده در مناطق تحت انتخاب شناسایی گردید. برهمکنش گروههای ژنی و مجسم سازی شبکه با استفاده از پایگاه اطلاعاتی string برای ژنهای مرتبط با ذخیره چربی انجام شد. این پژوهش منجر به شناسایی چندین مسیر بیولوژیکی شد که به طور مستقیم یا غیر مستقیم با اسکلت ، ساختار اندازه بدن و پاسخ به لیپیدها بودند ژنهای ACAN،HOXC ،IHH ،IGF1 ،HOXB ، BMP2، BMP4،RARG ،OSBPL7 ،NFE2L1 ،NCOA3 ، TRIP4، SAR1B،SEC24A وNR1H4 شناسایی شدند. همچنین نتایج نشان داد که از بین ژنهای شناسایی شده، ژن BMP2 ارتباط بیشتری با ژنهای دیگر دارد. نتایج مطالعه حاضر و سایر مطالعات نشان داد که فرآیند متابولیسم چربی تحت تاثیر شبکه تنظیم ژنی بیش از 15 ژن مهم و ارتباط با تعداد زیادی از ژنهای دیگر قرار دارد.
|
پژوهشگران
|
علی اسمعیل زاده (نفر چهارم)، محمد حسین مرادی (نفر سوم)، محمد تقی بیگی نصیری (نفر دوم)، سوسن رادپور (نفر اول)
|