مشخصات پژوهش

عنوان	پویش ژنومی صفات مرتبط با تولید و ترکیبات شیر گوسفند-ارزیابی مقایسه‌ای رویکردهای تک مرحله ای وزن دهی شده با تک مرحله ای بیزی
نوع پژوهش	مقاله چاپ‌شده
کلیدواژه‌ها	ارزیابی ژنومی، تک مرحله‌ای، ژن کاندیدا، گوسفند شیری، واریانس ژنتیکی
چکیده	در پرورش گوسفند هدف اصلی افزایش سودآوری است. بیماری ورم پستان یکی از مشکلات اصلی پرورش گوسفندان شیری با کاهش طول عمر اقتصادی و افزایش هزینه‌ها است. هدف پژوهش حاضر، بررسی معماری ژنتیکی و مقایسه میزان واریانس ژنتیکی افزایشی توجیه شده در روش‌ تک مرحله‌ای وزن‌دهی شده (WssGWAS) و روش تک مرحله‌ای بیزB (SS-BayesB) برای صفات مرتبط با تولید و ترکیبات شیر و تعداد سلول‌های بدنی در گوسفند می‌باشد. میزان واریانس ژنتیکی توجیه شده هر یک از SNPها توسط هر کدام از رویکردها به ترتیب با استفاده از نرم افزار BLUPF90 و JWAS در قالب پنجره‌های ژنومی 1 مگابازی محاسبه گردید. نتایج این پژوهش نشان داد روش WssGWAS از نظر میزان واریانس ژنتیکی افزایشی توجیه شده در مقایسه با روش SS-BayesB عملکرد بهتری داشت. پنجره‌های ژنومی شناسایی شده حاصل از این رویکرد روی کروموزوم‌های 1، 2، 3، 4، 6، 9 و 25 قرار داشتند و داخل یا نزدیک به 48 ژن‌های کاندیدای مکانی مرتبط با صفات قرار گرفته بودند و از این بین ژن‌های کاندیدا عملکردهای مهمی در تولید شیر، متابولیسم لیپید و سنتز اسیدهای چرب، سنتز اسیدهای آمینه، متابولیسم انرژی و ایجاد پاسخ ایمنی بر عهده داشتند. نتایج تحقیق حاضر نشان می‌دهد هنگامی که معماری صفات بررسی شده از مدل تعداد زیاد جایگاه ژنی پیروی کند، معمولاً روش‌ WssGWAS بر SS-BayesB ارجحیت دارد. علاوه بر این، با توجه به نقش کلیدی ژن‌های ذکر شده در ایجاد پاسخ ایمنی و تولید شیر می‌توان کارایی روش WssGWAS را برای پویش ژنومی صفات مرتبط با تولید شیر گوسفند را مورد تأیید قرار داد.
پژوهشگران	محمد شمس اللهی (نفر دوم)، حسین محمدی (نفر اول)