مشخصات پژوهش

عنوان	مطالعه تنوع تعداد کپی روی کروموزوم جنسی در برخی از نژادهای گوسفند ایرانی
نوع پژوهش	مقاله چاپ‌شده
کلیدواژه‌ها	گوسفند ،SNP ،CNV .PennCNV
چکیده	تنوع تعداد کپی ( )CNVیکی از مهمترین تغییرات ساختاری در ژنوم است که نقش مهمی در واریانس ژنتیکی صفات اقتصادی دارند. در این مطالعه CNVها و نواحی تنوع تعداد کپی ( )CNVRروی کروموزوم جنسی سه نژاد گوسفند بومی ایرانی شامل نژادهای دنبه دار بلوچی و لریبختیاری و نژاد بدون دنبه زل بررسی شدند. ژنوتیپ K 50نمونهها جمعآوری و CNVها برای هر فرد با استفاده از نرم افزار PennCNVشناسایی شدند. سپس کنترل کیفیت CNVها با فیلترهای مختلف انجام شد و CNVRها با استفاده از نواحی همپوشان CNVها با استفاده از نرم افزار CNVRuler v1.5شناسایی شدند. در مجموع، تعداد 11 ،37و CNV 4از نوع اضافه به ترتیب روی کروموزوم Xگوسفند بلوچی، زل و لری-بختیاری شناسایی شد. کمترین، بیشترین و میانگین طول CNVهای شناسایی شده، به ترتیب 1293154 ،94477و 447694جفتباز در نژاد بلوچی ، ،271819 906644و 674854جفتباز در نژاد زل و 306525 ،99705و 167913جفتباز در نژاد لری بختیاری بود. پس از ادغام CNVها به ترتیب تعداد 10 ،30و CNVR 4در این سه نژاد شناسایی شد که همگی از نوع اضافه بودند. بررسی عمکلرد ژنهای نواحی CNVRنشان داد که برخی از این ژنها (،VAM21 ،VEGF APLN ،NDUFA1 ،TRPC5و )TNMDبا متابولیسم چربی در ارتباط بودند. حاشیهنویسی ژنها برای عملکرد مولکولی، به طور معنیداری در مسیر arylsulfatase activityغنی سازی شدند که در تولید مثل نقش دارد. مطالعات بیشتر روی این مناطق CNVمی تواند به شناسایی واریانتهای سببی موثر بر متابولیسم چربی در گوسفند کمک نماید.
پژوهشگران	محمد حسین مرادی (نفر چهارم)، ایوب فرهادی (نفر سوم)، محسن قلی زاده (نفر دوم)، هادی یزدانی (نفر اول)