مشخصات پژوهش

عنوان	شناسایی نشانه های انتخاب مرتبط با مقاومت به بیماری یون (JD) در نژادهای بز
نوع پژوهش	مقاله چاپ‌شده
کلیدواژه‌ها	آماره تتا، بیماری یون، سیستم ایمنی، سیگنال های انتخاب
چکیده	پاراتوبرکلوزیس یا بیماری یون (JD) یکی از بیماری‌های مهم مزمن التهاب روده‌ای در نشخوارکنندگان است. هدف پژوهش حاضر، شناسایی نشانه‌های انتخاب با استفاده از آماره ناِاُریب تتا مرتبط با مقاومت به بیماری یون در دو نژاد بز جانیکا و سیریانا می‌باشد. به این منظور، مجموع 331 حیوان برای 53345 جایگاه نشانگری SNP با استفاده از تراشه‌های Caprine SNP50 BeadChip تعیین ژنوتیپ شدند. پس از کنترل کیفیت داده‌های اولیه در نهایت، 51182 نشانگر SNP و 326 رأس دام وارد آنالیزهای بعدی شدند. حیوانات مورد استفاده بر اساس آزمون آنتی‌بادی سرم خون (الایزا) در دو دسته مقاوم به بیماری یا سالم (162) و بیمار (164) گروه‌بندی شدند. با در نظر گرفتن صدک 9/99 کل ارزش‌های تتا، سیزده ناحیه ژنومی در نژاد جانیکا روی کروموزوم-های 1، 5، 7 (دو منطقه)، 8، 9 (دو منطقه)، 11، 16، 17، 18 و 20 (دو منطقه) شناسایی شدند. همچنین، در نژاد سیریانا نواحی ژنومی روی کروموزوم‌های 3، 5 (دو منطقه)، 10، 12، 16، 17، 18، 23، 24 و 29 بالاتر از این دامنه بودند، شناسایی شدند. بررسی ژن‌های گزارش شده در این مناطق نشان داد که در داخل یا مجاورت این نواحی، ژن‌های IL4، IL13، TLR2، TLR4، IFNGR1، PGLYRP1، CHI3L2، PPFIBP1 و DENND5B قرار داشتند. بررسی بیوانفورماتیکی این مناطق نشان داد، ژن‌های موجود در این مناطق با سیستم ایمنی، مقاومت به بیماری و عفونت باکتریایی، پاسخ به استرس اکسیداتیو و سرکوب سرطان مرتبط هستند. نتایج این تحقیق می‌تواند منبع اطلاعاتی ارزشمندی در زمینه شناسایی مناطق ژنومی و در نتیجه، ژن‌های مرتبط با بیماری یون در نژادهای مختلف بز فراهم آورد.
پژوهشگران	محمد شمس اللهی (نفر دوم)، حسین محمدی (نفر اول)