مشخصات پژوهش

عنوان	مطالعه تجزیه و تحلیل غنی سازی مجموعه های ژنی جهت شناسایی جایگاه های ژنی مرتبط با بیماری لکوز در گاوهای شیرده نژاد هلشتاین
نوع پژوهش	مقاله ارائه‌شده
کلیدواژه‌ها	ژنوتیپ، لنفوسیت، لوسمی گاوی، GSEA، GWAS، SNP
چکیده	لوسمی گاوی عامل اصلی ابتلا به لکوز می‌باشد که منجر به ایجاد لنفوسیت‌های سرطانی در ارگانیسم‌های مختلف بدن شده و گونه-های متفاوتی ازجمله گاو را درگیر می‌کند. این بیماری باعث کاهش تولید شیر و ایجاد بیماری‌های تولید‌مثلی و در نهایت حذف دام مبتلا می‌شود. در پژوهش حاضر، با استفاده از آنالیز تجزیه و تحلیل غنی‌سازی مجموعه ژنی (GSEA ) جایگاه‌های ژنی مرتبط با این بیماری مشخص و آلل‌های حساس و مقاوم نیز شناسایی شدند. بدین‌منظور، از مجموع 150رأس گاو نمونه خون جمع‌آوری، پس از استخراج DNA و تعیین ژنوتیپ با استفاده از ریزآرایه‌های k30 (SNPchip 30K)، کنترل کیفیت و آزمون معنی‌داری توسط نرم‌افزار PLINK انجام و در نهایت توسط سایت Ensemble ژن‌های مرتبط با نشانگرهای انتخاب شده شناسایی شد. مهمترین ژن‌های شناسایی شده مرتبط با این جایگاه‌ها TNFAIP3، TLR4، CD180، ERBIN، MAPK14، PRKCB، BMP5 و IL1R1 هستند که در فرآیندهای آپوپتوز، تنظیم سلول‌های B و T، پاسخ ایمنی ذاتی و التهابی، فاکتور نکروز تومور، تنظیم پاسخ دفاعی، تنظیم رونویسی و پاسخ سلولی به ویروس دخالت دارند.
پژوهشگران	یونس دوستی (نفر پنجم)، حسین محمدی (نفر چهارم)، محمد مرادی شهر بابک (نفر سوم)، حسین مرادی شه بابک (نفر دوم)، فرناز ارجمند (نفر اول)