مشخصات پژوهش

عنوان	مطالعه تجزیه و تحلیل غنی سازی مجموعه های ژنی جهت شناسایی جایگاه های ژنتیکی مرتبط با بیماری یون در گاوهای شیرده هلشتاین
نوع پژوهش	مقاله ارائه‌شده
کلیدواژه‌ها	مایکوباکتریوم، ژنوتیپ، سوماتیک، GSEA، GWAS، SNP
چکیده	مایکو باکتریوم آویوم عامل بیماری یون می‌باشد. این بیماری در گاو شیری از لحاظ اقتصادی از مهم‌ترین و از جنبه شیوع جزء گسترده ترین بیماری‌ها می‌باشد که باعث کاهش چربی و پروتئین و افزایش سلولهای سوماتیک شیر می‌شود.با استفاده از آنالیز تجزیه تحلیل غنی‌سازی مجموعه ژنی (GSEA ) جایگاه‌های ژنی مرتبط با این بیماری مشخص و آلل‌های حساس و مقاوم نیز شناسایی شدند. بدین منظور از مجموعه 150راس گاو نمونه خون جمع آوری و پس از استخراج DNA و تعیین ژنوتیپ، با استفاده از ریز آرایه های k30 (SNPchip30k) کنترل کیفیت و آزمون معنی داری توسط نرم افزار PLINK انجام و در نهایت توسط سایت ensemble ژنهای مرتبط با نشانگر‌های انتخاب شده شناسایی شد. مهمترین ژن‌های شناسایی شده مرتبط با این جایگاه‌ها TNFAIP3، LY96، PRKCD، MAP3K7، CSF1R، CD244، CORO1A و IRF4 هستند که بیشتر در مسیرهای آپوپتوز، تنظیم سلول‌های B و T، پاسخ ایمنی ذاتی، فاکتور نکروز تومور، تنظیم پاسخ دفاعی، تنظیم رونویسی، فسفریلاسون پروتئین و پاسخ سلولی به باکتری دخالت دارند.
پژوهشگران	فرناز ارجمند (نفر پنجم)، حسین محمدی (نفر چهارم)، حسین مرادی شه بابک (نفر سوم)، محمد مرادی شهر بابک (نفر دوم)، یونس دوستی (نفر اول)