مشخصات پژوهش

عنوان	کاوش ژنومی نشانه های انتخاب برای رنگ پشم درگوسفندان ایرانی با استفاده از روش-های برآوردگر نااُریب hapFLKوFST
نوع پژوهش	مقاله ارائه‌شده
کلیدواژه‌ها	نشانه های انتخاب، سازگاری محیطی، روش های آماری مبتنی بر LD
چکیده	نشانههای انتخاب به شناسایی مناطقی از ژنوم که در طی سالهای متمادی بصورت طبیعی و یا مصنوعی انتخاب شدهاند،کمک میکند. هدف از این تحقیق شناسایی نشانههای انتخاب برای رنگ پشم در گوسفندان ایرانی بود. برای این منظور از آرایههای ژنومی80Illumina ovine SNP600K BeadChipرأسگوسفندپشم رنگی(قرهگل، سیاهکبود و کبودهشیراز)و پشم سفید (سنجابی، کرمانی و بلوچی) استفاده شد. برای شناسایی نشانههای انتخاب از دو آزمون آماری برآوردگر نااریب (FSTتتا) وhapFLKاستفاده شد. نتایج این تحقیق منجر به شناسایی 26منطقۀژنومیرویکروموزومهای 19 ،6 ،2 ،1و 24با استفاده از آزمون تتا و 7منطقه ژنومی روی کروموزومهای 6و 19با استفاده از آزمون hapFLKبه عنوان مناطق کاندیدای تحت انتخاب برای رنگ پشم شد. بررسی ژنهای شناسایی شده در این مناطق نشان داد که بسیاری از این مناطق با ژنهایمؤثربرصفات رنگدانه و مشخصات پشم (،MITF ،KIT وMAD1L1 ،ELFN1 ،MIR339() و سرطانP2RY( ،) اتساع عروق و پاسخ ایمنیMICALL2( ،) عضلاتPDGFRA وIGSF10 )GPR87همپوشانیدارند. در نهایت آنالیزهای هستیشناسی و بررسی شبکههای ژنی نشان داد که ژنهای گزارش شده در مناطق ژنومی شناسایی شده، با مسیرهای درگیر در تمایز ملانوسیت و رنگدانهها، تمایز سلولهای بنیادی، فرآیندهای سلولی، توسعه سیستم ایمنی، سیستم خونی، فرآیندهای باروری و سلولی ارتباط داشتند. در مجموع، نتایج میتواند اطلاعات ازشمندی در زمینه شناسایی ژنهای مرتبط با رنگ پشم در گوسفندان ایرانی فراهم کند.
پژوهشگران	امیر رشیدی (نفر پنجم)، محمد حسین مرادی (نفر چهارم)، علی اسمعیل زاده (نفر سوم)، محمد رزم کبیر (نفر دوم)، زهرا پتی آبادی (نفر اول)