مشخصات پژوهش

صفحه نخست /شناسایی و آنالیز بیان RNAهای ...
عنوان شناسایی و آنالیز بیان RNAهای غیر کدشونده در گناد تاسماهی روسی با استفاده از دادههای RNA-Seq
نوع پژوهش پایان نامه های تقاضا محور و غیر تقاضا محور
کلیدواژه‌ها تاسماهی روسی، چالباش، RNAهای غیر کدشونده، رونوشتهای گناد
چکیده یکی از باستانیترین و با ارزشترین ماهیان دریای خزر، که در معرض خطر انقراض قرار دارد تاسماهی روسی یا چالباش ) (Acipenser gueldenstaedtiiمیباشد که هنوز مکانیسم ژنتیکی کنترلکننده جنسیت در این گونه به طور کامل شناسایی نشده است. مطالعات در زمینهی تعیین جنسیت و تمایز جنسی در سطوح مولکولی، هم در حفظ ذخایر و هم در پرورش ماهیان خاویاری کاربرد دارد. در سالهای اخیر RNAهای غیر کدشونده ) (ncRNAsمورد توجه جوامع علمی قرار گرفته است. به دلیل پیشرفت در فنآوریهای توالییابی پُربُرونداد درک ما از ncRNAها به میزان قابل توجهی تغییر کرده است. شواهد زیادی حاکی از این است که انواع مختلف ncRNAدر رشد و نمو، و مسیرهای مختلف فیزیولوژیکی از جمله تعیین جنسیت، گنادزایی، تقسیم میوز، گامتزایی و تولید مثل جنسی نقش دارند. RNAهای غیر کدشوندهی بلند ( ،)lncRNAدر بافتهای موجودات مختلف شناسایی شدهاند، ولی اکثر مطالعات روی تعداد محدودی از ارگانیسمها متمرکز شده است و اطلاعات کمی در مورد ncRNAها در ارگانیسمهای غیر مدل مانند ماهیان خاویاری وجود دارد. به همین منظور در این پژوهش، با استفاده از آنالیز دادههای ،RNA-Seqبه شناسایی lncRNAها در گناد تاسماهی روسی همراه با آنالیز بیان متفاوت آنها میان دو جنس، پرداخته شد. پس از اعمال فیلترهای سخت- گیرانه، مجموعاً تعداد lncRNA 5720ی احتمالی از گناد هر دو جنس شناسایی شد که تعداد 4660از آنها، دارای تفاوت بیان معنیدار در تخمدان و بیضه بودند. همچنین بررسیهای بیشتر نشان داد که تعداد 2508 lncRNAدر گناد مادهها و lncRNA 56در گناد نرها به طور اختصاصی بیان میشوند. در مجموع نتایج این تحقیق نشان میدهد lncRNAها میتوانند نقش قابل توجهی در روشن شدن مکانیسم تعیین جنسیت در ماهیان خاویاری داشته باشند. امید است، دیدگاهی که این پژوهش در مورد lncRNAها در گناد تاسماهی روسی فراهم آورده است، منجر به تحقیقات هر چه بیشتر در مورد مکانیسمهای تنظیمکنندهی lncRNAها در فرآیند تمایز جنسی، تمایز و بلوغ گنادها و گامتزایی در تاسماهی روسی و سایر گونههای ماهیان خاویاری شود.
پژوهشگران نسترن تمدن (دانشجو)، محمد حسین مرادی (استاد مشاور)، اردشیر نجاتی جوارمی (استاد راهنما)