مشخصات پژوهش

عنوان	بررسی الگوی عدم تعادل پیوستگی در برخی گوسفندان بومی
نوع پژوهش	مقاله چاپ‌شده
کلیدواژه‌ها	Genomic Selection(GS),Genome Wide Association Studies(GWAS)Linkage Disequilibrium(LD)
چکیده	شناخت الگوی عدم تعادل پیوستگی در جمعیت های مختلف اطلاعات بسیار مهمی برای مطالعات انتخاب ژنومیک(GS) و پویش پیوستگی ژنوم(GWAS) و شناخت معماری ژنتیکی صفات فراهم می کند. هدف از این مطالعه بررسی وسعت عدم تعادل پیوستگی در برخی گوسفندان بومی است. بدین منظور از 190 نمونه گوسفند بومی(شامل 96 نمونه بلوچی، 47 نمونه لری بختیاری و47 نمونه زل) خون گیری و با استفاده از آرایه های Ovine 50K SNPChipشرکت ایلومینا تعیین ژنوتایپ شد. نتایج این مطالعه نشان داد، بالاترین میانگین LD هر نژاد در فواصل کمتر از Kb10 در نژاد بلوچی، لری بختیاری و زل به ترتیب 0.323±0.392 ، 0.308±0.360 و 0.306±0.340 بود. با بررسیLDدرکروموزم های اتوزوم هر نژاد،کروموزم های24و 25 از نژاد بلوچی، کروموزم 9 و 21 از نژاد لری بختیاری و در نژاد زل کروموزم 23 و 24 دارای بیشترین میانگین r2بودند.با افزایش فاصله بین نشانگر ها عدم تعادل پیوستگی در سطح ژنوم کاهش یافت به طوری که در فواصل بیش ازKb100 به کمتر از 0.1 رسید.هر چه وسعت عدم تعادل پیوستگی بالاتر باشد تراکم نشانگری پایین تری در مطالعات ارتباطی نیاز است. نتایج این مطالعه مشخص نمود برای حصول صحت 85 درصدی در مطالعات انتخاب ژنومیک و GWASبه آرایه هایی با تراکم نشانگری بالاتر از 50K نیاز خواهد بود.
پژوهشگران	محمد حسین مرادی (نفر چهارم)، محسن قلی زاده (نفر پنجم)، محمد مرادی شهر بابک (نفر دوم)، سمیه بارانی (نفر اول)، اردشیر نجاتی جوارمی (نفر سوم)