عنوان	پویش پیوستگی ژنومی جهت شناسایی ژن های کاندیدا و مسیرهای زیستی مرتبط با مقاومت به بیماری سل گاوی بر پایه آنالیز غنی سازی مجموعه های ژنی
نوع پژوهش	مقاله چاپ‌شده
کلیدواژه‌ها	پویش کل ژنومی، غنی سازی مجموعه ژنی، سل گاوی، گاو شیری هلشتاین.
چکیده	شناسایی مسیرهای زیستی و ژنهای مرتبط با بیماریها یکی از مهمترین اهداف برنامههای اصلاحنژادی در گاو شیری است. پژوهش حاضر به منظور مطالعه پویش پیوستگی ژنومی جهت شناسایی ژنهای کاندیدا و مسیرهای زیستی مرتبط با مقاومت به بیماری سل گاوی بر پایه آنالیز غنیسازی مجموعههای ژنی انجام شد. به این منظور از اطلاعات مجموع، 1355 رأس گاو هلشتاین ) 685 حیوان بیمار و 670 حیوان شاهد( از 178 گله استفاده شد که پس از انجام مراحل مختلف کنترل کیفیت، اطلاعات ژنوتیپی 592 نمونه گاو بیمار و 559 نمونه گاو سالم در آنالیزهای نهایی استفاده شدند. تعیین ژنوتیپ این حیوانات با استفاده از تراشههای ژنومی Illumina BovineHD 700k BeadChip برای 727252 جایگاه نشانگری SNP انجام شد. پویش پیوستگی ژنومی ) GWAS ) با استفاده از مدلهای خطی مختلط لجستیک مورد بررسی قرار گرفت و مناطقی از ژنوم که در سطح 05 / 0 با بیماری سل گاوی در ارتباط بودند به منظور شناسایی ژنهای کاندیدا و مسیرهای زیستی مرتبط با مقاومت به بیماری سل گاوی بر پایه آنالیز غنیسازی مجموعههای ژنی استفاده شد. نتایج این تحقیق در نهایت منجر به شناسایی مسیرهایی، از قبیل مسیرهای تنظیم مثبت فرآیند آپوپتوز، سازماندهی اتصالات سلولی، تنظیم منفی تولید سیتوکین و تنظیم پاسخ دفاعی شد که به طور معنیداری با بیماری سل گاوی در ارتباط بودند. بررسی این مسیرها نشان داد که اغلب آنها با سیستم ایمنی، کنترل استرس و مقاومت در برابر بیماریها در ارتباط هستند. همچنین ارزیابی عملکرد ژنهای موجود در این مسیرها نشان داد که ارتباط مستقیم برخی از این ژنها مانند SLC11A1 ، SLC2A2 و CD80 و غیر مستقیم ژنهایی مانند BCL6 ، HSPD1 ، KCNMA1 ، SPP1 ، CD24 ، MYO1B ، CCL20 ، و LCP2 با مقاومت به بیماریها و سل گاوی در تحقیقات گذشته نیز تأیید شده است. در مجموع، با توجه به اهمیت شناسایی جایگاههای ژنی تأثیرگذار بر سل گاوی از دیدگاه علمی و اقتصادی، نتایج این تحقیق نشان میدهد مقاومت به بیماری سل گاوی با مسیرهای زیستی و ژنهای کاندیدای مرتبط با سیستم عصبی، ایمنی ذاتی، پاسخ به التهابات، تنظیم پاسخ ایمنی، اتصالات سلولی و هموستازی گلوکز ارتباط نزدیکی دارد.
پژوهشگران	امیر حسین خلت آبادی فراهانی (نفر سوم)، محمد حسین مرادی (نفر دوم)، حسین محمدی (نفر چهارم)، محسن عبداللهی (نفر اول)