عنوان	شناسایی مناطق ژنومی مرتبط با برخی از خصوصیات مورفولوژیکی درگوسفندان نژاد لری بختیاری
نوع پژوهش	پایان نامه های تقاضا محور و غیر تقاضا محور
کلیدواژه‌ها	صفات ریخت شناسی، گوسفندان ایرانی، نشانگر ،SNP آنالیز بیوانفورماتیکی
چکیده	شناسایی ژنهای کاندیدای مؤثر بر صفات مهم اقتصادی یکی از مهمترین اهداف اصلاحنژادی در پرورش گوسفند است. پژوهش حاضر با هدف شناسایی مناطق ژنومی مرتبط با برخی از خصوصیات مورفولوژیکی شامل شاخداری و رنگ پوشش بدن در نژاد لریبختیاری انجام گردید. به این منظور جهت افزایش تعداد نمونه، اطلاعات ژنومی نژاد زل نیز در طی انجام تحقیق به آن اضافه شد. به این ترتیب در مجموع اطلاعات ژنومی 83نمونه (شامل 67حیوان شاخدار و 16حیوان بدون شاخ) و 77نمونه (شامل 34حیوان کاملاً سفید و 43نمونه حیوان با پوشش رنگی) به ترتیب برای دو صفت شاخداری و رنگ پوشش، در برنامه ( Rنسخه )4/3/1با استفاده از روش برآوردگر نااریب تتا ارزیابی شدند. جهت بررسی نحوه اختصاص حیوانات به گروههای نژادی و مورفولوژیکی خود از آنالیز مؤلفههای اصلی ()PCA استفاده شد و ژنهای کاندیدای گزارش شده در مناطق ژنومی شناسایی شده از پایگاههای برخط Biomartجستجو شدند. درنهایت برای بررسی عملکرد ژنها از جستجوی برخط OMIMدر پایگاه NCBIو یا پایگاه اطلاعاتی DAVID استفاده شد. نتایج آنالیز PCAبرای دو صفت مورد مطالعه بیانگر این بود که دو نژاد لریبختیاری و زل به طور کامل در مؤلفه اصلی اول ( )PC1از همدیگر تفکیک میشوند و با توجه به اینکه تنوعی از صفات مربوط به شاخداری و رنگ پوشش در هر دو نژاد وجود داشت، طبق انتظار حیوانات مربوط به گروهبندیهای مختلف در هر دو نژاد پراکنده شدند. در مجموع نتایج حاصل از تحقیق حاضر منجر به شناسایی 38منطقه ژنومی روی کروموزومهای ،9 ،7 ،5 ،4 ،3 ،2 ،1 25 ،24 ،21 ،17 ،16 ،14 ،12 ،11 ،10و Xدر ارتباط با صفت شاخداری و 22منطقه ژنومی روی کروموزومهای ،2 ،1 ،23 ،22 ،19 ،17 ،15 ،13 ،12 ،9 ،7 ،6 ،4 ،3و Xدر ارتباط با رنگ پوشش در گوسفندان بومی گردید که برخی از این مناطق ژنومی به طور مستقیم و یا غیرمستقیم با ژنهای مؤثر بر صفت شاخداری و رنگ پوشش بدن ارتباط داشتند. از مهمترین ژنهای کاندیدای شناسایی شده مرتبط با صفات مورد مطالعه در تحقیق حاضر میتوان به ،GATA1 ،RXFP2 اشاره کرد. از طرف دیگر نتایج حاصلPCDH19 وPRR9 ،FOXI3 ،LRRC42 ،FRY ،SPRR2A ،GPR161 ،TP63 منجر به شناسایی ژنهایی دیگری نیز شد که به طور غیر مستقیم با صفات مورفولوژیکی موردنظر در این تحقیق در ارتباط بودند که از مهمترین آنها میتوان به ژنهای ،SHOX2 ،CHCHD7 ،PLAG1 ،MSRB3 ،HMGA2 ،OPN4 ،CEPT1 ،PRKAA1 ،SLC7A5 ،MAP1LC3B ،)، (صفت رشدZNF395 ,MYL2 ،SMYD3 ،CACNA2D3 ،TFB2M PTGER4 ،CCDC63 ،GSK3B ،OVGP1 ،ACTLA7 ،) (صفت چربیPSD2 ،HSD17B10 ،ZNF516 TMEM68 وPHF21B ،)، (سیستم ایمنیKIF135 ،CD80 ،CHI3L2 ،IRAK3 ،CTNNAL1 ،CARD6 ،)(صفت تولیدمثل ( DNAJC18استرس دمایی)، اشاره نمود. در مجموع، نتایج این تحقیق میتواند منبع اطلاعاتی ارزشمندی در راستای شناسایی مناطق ژنومی مرتبط با خصوصیات مورفولوژیکی در گوسفندان ایرانی فراهم آورد.
پژوهشگران	امیر حسین خلت آبادی فراهانی (استاد مشاور)، محمد حسین مرادی (استاد راهنما)، حسین محمدی (استاد مشاور)، مصطفی سمیاری (دانشجو)