امیر حسین خلت آبادی فراهانی

شناسایی ژن های مؤثر بر صفات مهم اقتصادی یکی از مهم ترین اهداف اصلاح نژادی در پرورش گاو شیری است. پژوهش حاضر به منظور مطالعه پویش پیوستگی ژنومی جهت شناسایی ژن های کاندیدا و مسیرهای زیستی مرتبط با مقاومت به بیماری سل گاوی بر پایه آنالیز غنی سازی مجموعه های ژنی انجام شده است. به این منظور از اطلاعات مجموع، 1355 رأس گاو هلشتاین (685 حیوان بیمار و 670 حیوان شاهد) از 178 گله استفاده شد که از بین این حیوانات 592 نمونه گاو بیمار و 559 نمونه گاو سالم تعیین ژنوتیپ شده اند. تعیین ژنوتیپ این حیوانات با استفاده از تراشه های ژنومیIllumina BovineHD 700k BeadChip برای 727252 جایگاه نشانگری SNP انجام شده است. پویش پیوستگی ژنومی (GWAS) با استفاده از مدل-های خطی مختلط لجستیک مورد بررسی قرار گرفت و مناطقی از ژنوم که در سطح 05/0 با بیماری سل گاوی در ارتباط بودند به منظور شناسایی ژن های کاندیدا و مسیرهای زیستی مرتبط با مقاومت به بیماری سل گاوی بر پایه آنالیز غنی سازی مجموعه های ژنی استفاده شد. نتایج این تحقیق در نهایت منجر به شناسایی مسیرهایی شد که به طور معنی داری با بیماری سل گاوی در ارتباط بودند. بررسی این مسیرها نشان داد که اغلب آنها با سیستم ایمنی، کنترل استرس و مقاومت در برابر بیماری ها در ارتباط هستند. همچنین ارزیابی عملکرد ژن های موجود در این مسیرها نشان داد که ارتباط مستقیم یا غیر مستقیم برخی از این ژن ها مانند HSPD1، Bcl6، MPP5، XIRP1، SPP1، KCNMA1، CD24، MYO1B، CCL20، CXCR1، SLC11A1، LCP2 و SLC2A2 با بیماری سل گاوی در تحقیقات گذشته نیز تأیید شده است. در مجموع، با توجه به اهمیت شناسایی جایگاه های ژنی تأثیرگذار بر سل گاوی از دیدگاه علمی و اقتصادی، نتایج این تحقیق می تواند در شناسایی مسیرها و ژن های تأثرگذار بر این صفت و درنتیجه بهبود عملکرد دام ها به خصوص در صنعت پرورش گاو شیری دارای اهمیت زیادی باشد.