هدف: شناسایی ژن های بزرگ اثر مؤثر بر صفات مهم اقتصادی یکی از مهم ترین اهداف اصلاح نژادی در پرورش مرغ است. پژوهش حاضر به منظور مطالعه پویش ژنومی بر اساس آنالیز مجموعه های ژنی برای شناسایی جایگاه های ژنی مؤثر بر صفات مرتبط با وزن تخممرغ نژاد رُد آیلند رِد با استفاده از آرایه های ژنومی با تراکم بالا بوده است. مواد و روشها: اطلاعات رکورد های فنوتیپی و ژنوتیپی مرتبط با وزن تخممرغ نمونه ها از پایگاه ذخیره ژنومی برخط Figshare استفاده شد. آنالیز پویش کل ژنومی بر پایه آنالیز مسیر در سه مرحله تعیین مکان SNPهای معنی دار با ژن، ارتباط ژن ها به طبقات عملکردی و مسیرهای بیوشیمیایی و پویش کل ژنومی بر پایه آنالیز مسیر انجام می شود. بر این اساس، مطالعه پویش ژنومی برای صفات وزن تخممرغ در اولین تخمگذاری و 28، 36، 56، 66، 72 و 80 هفتگی در 1078 قطعه مرغ در برنامه GenABEL انجام شد. سپس با استفاده از بسته نرم افزاری biomaRt2 ژنهای معنیداری که در داخل و یا 20 کیلوباز بالادست یا پایین دست نشانگرهای SNP معنیدار قرار داشتند، شناسایی گردید. در نهایت تفسیر مجموعه ژنی با بسته نرم افزاری goseq برنامه R با هدف شناسایی عملکرد بیولوژیکی ژن های نزدیک به مناطق انتخابی و ژن های کاندیدا از طریق پایگاه های GO، KEGG، DAVID و PANTHER انجام شد. نتایج: در این پژوهش تعداد 9 نشانگر تک نوکلئوتیدی واقع روی کروموزوم های 3، 4، 6، 7، 8، 9، 19، 20 و 22 شناسایی شدند که با ژن هایMC3R ،LEPR ، ECT2، SH3GL2، KCNMA1، SPP1، PCK1، MMP9، PPP1CB، ACOX1 و IGFBP2 مرتبط بودند. تعدادی از این نشانگرهای شناسایی شده در مناطق ژنومی معنی دار با مطالعه پیشین مرتبط با وزن تخممرغ همخوانی داشتند. در تفسیر مجموعه ژنی تعداد 28 مسیر هستی شناسی ژنی و بیوشیمیایی با صفات وزن تخممرغ شناسایی شد (P˂0.01). از این بین، مسیرهایRegulation of feeding behavior،Positive Regulation of apoptotic process،Positive regulation of protein phosphorylation osteoblast differentiation، Positive regulation of gluconeogenesis، Cell-cell junction وFocal adhesion عملکرد های مهمی را در ارتباط با وزن تخممرغ و فرآیند تولید تخم مرغ از طریق رشد اووسیت و تخمکاندازی، تشکیل پروتئین آلبومین و تشکیل پوسته تخم مرغ بر عهده داشتند. نتیجه گیری: با توجه ب
