حسین محمدی

بکارگیری روش آماری مناسب در مطالعات پویش ژنومی یکی از عوامل اصلی برای شناسایی مناطق ژنومی مرتبط با صفات مهم اقتصادی است. لذا هدف از انجام پژوهش حاضر، محاسبه میزان واریانس ژنتیکی توجیه شده روش­های چند مرحله­ای بیزی شامل BayesA، BayesB و BayesCπ برای صفات مرتبط با ساختار بدن در گاوهای شیری آمیخته بود که با تراشه­های 50K گاو تعیین ژنوتیپ شده بودند. برای هر دام، پنج صفت شامل ارتفاع قد از جدوگاه، دور سینه، طول بدن، عمق سینه و فاصله دو هیپ رکورد جمع آوری شده بود و با استفاده از بسته نرم افزاری hibayes در محیط R میزان اثر هر یک SNPها برآورد گردید. میزان واریانس ژنتیکی توجیه شده در روش BayesA نسبت به سایر روش­ها بیشتر برآورد گردید. کمترین و بیشترین میزان واریانس توجیه شده به ترتیب مربوط به صفات دور سینه (5/­12%­) و طول بدن (7/­21%­) به­دست آمد. پنجره­های ژنومی با بیشترین واریانس ژنتیکی روی کروموزوم­های 4، 5، 6، 7، 10، 11، 16 و 23 قرار داشتند و شامل ژن­های کاندیدای PRDX6، ATF3، ARAP2، PDE1B،­CHCHD3 ، TBPL2، SYN3 و PTBP1 بودند. ژن­های شناسایی شده عملکرد‌های مهمی را در ارتباط با سنتز کلاژن، فرآیند استخوان­سازی، رشد عضلات اسکلتی و تنظیم یون کلسیم بر عهده داشتند. نتایج تحقیق حاضر نشان می­دهد هنگامی که معماری صفات بررسی شده از مدل تعداد زیاد جایگاه ژنی پیروی کند، معمولاً روش­ BayesA بر بیزهای با انتخاب متغیر ارجحیت دارند. علاوه بر این، با توجه به شناسایی مناطق ژنومی جدید و نقش کلیدی ژن­های ذکر شده در ایجاد صفات ساختاری بدن می­توان کارآیی روش بیز A برای پویش ژنومی در صفات ساختاری بدن را تأیید کرد.