1403/02/24
حسین محمدی

حسین محمدی

مرتبه علمی: استادیار
ارکید: https://orcid.org/0000-0001-7333-2098
تحصیلات: دکترای تخصصی
اسکاپوس: 56354975800
دانشکده: دانشکده کشاورزی و محیط زیست
نشانی: دانشگاه اراک، گروه علوم دامی
تلفن:

مشخصات پژوهش

عنوان
مطالعه تجزیه و تحلیل غنی سازی مجموعه های ژنی جهت شناسایی جایگاه های ژنی مرتبط با بیماری لکوز در گاوهای شیرده نژاد هلشتاین
نوع پژوهش
مقاله ارائه‌شده
کلیدواژه‌ها
ژنوتیپ، لنفوسیت، لوسمی گاوی، GSEA، GWAS، SNP
سال 1402
پژوهشگران فرناز ارجمند ، حسین مرادی شه بابک ، محمد مرادی شهر بابک ، حسین محمدی ، یونس دوستی

چکیده

لوسمی گاوی عامل اصلی ابتلا به لکوز می‌باشد که منجر به ایجاد لنفوسیت‌های سرطانی در ارگانیسم‌های مختلف بدن شده و گونه-های متفاوتی ازجمله گاو را درگیر می‌کند. این بیماری باعث کاهش تولید شیر و ایجاد بیماری‌های تولید‌مثلی و در نهایت حذف دام مبتلا می‌شود. در پژوهش حاضر، با استفاده از آنالیز تجزیه و تحلیل غنی‌سازی مجموعه ژنی (GSEA ) جایگاه‌های ژنی مرتبط با این بیماری مشخص و آلل‌های حساس و مقاوم نیز شناسایی شدند. بدین‌منظور، از مجموع 150رأس گاو نمونه خون جمع‌آوری، پس از استخراج DNA و تعیین ژنوتیپ با استفاده از ریزآرایه‌های k30 (SNPchip 30K)، کنترل کیفیت و آزمون معنی‌داری توسط نرم‌افزار PLINK انجام و در نهایت توسط سایت Ensemble ژن‌های مرتبط با نشانگرهای انتخاب شده شناسایی شد. مهمترین ژن‌های شناسایی شده مرتبط با این جایگاه‌ها TNFAIP3، TLR4، CD180، ERBIN، MAPK14، PRKCB، BMP5 و IL1R1 هستند که در فرآیندهای آپوپتوز، تنظیم سلول‌های B و T، پاسخ ایمنی ذاتی و التهابی، فاکتور نکروز تومور، تنظیم پاسخ دفاعی، تنظیم رونویسی و پاسخ سلولی به ویروس دخالت دارند.