1403/10/07
حسین محمدی

حسین محمدی

مرتبه علمی: استادیار
ارکید: https://orcid.org/0000-0001-7333-2098
تحصیلات: دکترای تخصصی
اسکاپوس: 56354975800
دانشکده: دانشکده کشاورزی و محیط زیست
نشانی: دانشگاه اراک، گروه علوم دامی
تلفن:

مشخصات پژوهش

عنوان
پویش ژنگان کل برای تعیین جایگاه های تحت انتخاب مثبت در گوسفندان نژاد زندی
نوع پژوهش
مقاله چاپ‌شده
کلیدواژه‌ها
شناسایی نشانه های انتخاب، آزمونiHS ، پویش ژنگانی، آداپتاسیون
سال 1397
مجله علوم دامي ايران
شناسه DOI
پژوهشگران حسین محمدی ، عباس رافت ، حسین مرادی شه بابک ، جلیل شجاع ، محمد حسین مرادی

چکیده

شناسایی مناطق ژنگانی (ژنوم) که هدف انتخاب بودهاند، یکی از اهداف اصلی تحقیقات زیستی است. هدف این مطالعه، پویش کل ژنوم برای شناسایی مناطقی از ژنوم گوسفندان نژاد زندی که در طی سالهای مختلف هدف انتخابهای طبیعی یا مصنوعی قرار گرفتهاند، اجرا شده است. بدین منظور 96 رأس گوسفند نژاد زندی با استفاده از آرایههای ژنگانیIllumina ovine SNP50K BeadChip تعیین ژنوتیپ شدند. برای شناسایی نشانههای انتخاب بر پایه روشهای عدم تعادل لینکاژی از آزمون (iHS) integrated haplotype score استفاده شد. نتایج 11 منطقه ژنگانی روی کروموزومهای 1 (2 منطقه)، 3، 6، 7، 8، 9، 10، 17، 22 و 26 را شناسایی کرد. تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی نشان داد که برخی از این مناطق ژنگانی به طور مستقیم و غیر مستقیم با ژنهای مؤثر بر آداپتاسیون به آب و هوای گرم و خشک (DNAJB4، HSPA4L، MSRB3)، پاسخ ایمنی (IL23A، STAT6، LY96)، توسعه و اندازه بدن (STAC3، LAP3)، توسعه سیستم اسکلتی (SPP1، MEPE، IBSP) و متابولیسم انرژی (ATP5B، GLS2، CS) همپوشانی دارند. در نهایت بررسیQTLهای گزارش شده در ژنوم گوسفند نشان داد که این مناطق با QTLهای صفات مهم اقتصادی از جمله صفات مرتبط با رشد، لاشه و پشم در ارتباط میباشد. به هر حال، جهت شناسایی دقیق این ژنها و QTLها لازم است مطالعات پیوستگی و عملکردی بیشتری انجام شود.