مشخصات پژوهش

عنوان	بررسی مولکولی ویروس های جنس پوتی ویروس در مزارع ریحان استان سیستان و بلوچستان
نوع پژوهش	پایان نامه های تقاضا محور و غیر تقاضا محور
کلیدواژه‌ها	ریحان، ، فیلوژنی، ویروس موزاییک شلغم، ویروس موزاییک زرد لوبیا
چکیده	پوتیویروسها بیماریهای مهمی در محصوالت مختلف دنیا ایجاد مینمایند. طی ماههای فروردین و اردیبهشت سال 1397 ،90 نمونه ریحان و 21 نمونه علفهای هرز، از مزارع ریحان استان سیستان و بلوچستان جمعآوری شد. این نمونهها عالئم موزاییکی شدن، رگبرگ روشنی و موزائیک خفیف را نشان داد.. RNA با استفاده از کیت استخراج شد و PCR-RT با استفاده از آغازگرهای عمومی پوتیویروس انجام شد 8 نمونه مثبت و تعیین توالی گردید .بررسی توالیها در پایگاه بالست نشان داد که همه نمونهها شباهت با گونههای virus mosaic Turnip وvirus mosaic yellow Bean دارند. بعد از آن آغازگرهای اختصاصی دو ویروس TuMV و BYMV استفاده گردید. و در نتیجه قطعهای به طول 864 جفت باز در یک نمونه از basilicum Ocimum و sylvestris Malva بوسیله آغازگرهای TuMV تکثیر شد و قطعهای به طول 950 جفت باز در 6 نمونه ریحان بوسیله آغازگرهای BYMV تکثیر شد. بعد از آن همه نمونههای تکثیر شده، تعیین توالی گردید. بررسی تبارزایی بر اساس ژن پروتئین پوششی (CP (ویروس موزاییک شلغم نشان داد که دو جدایه ایرانی از TuMV در گروه BR Asian در کنار سایر جدایههای آسیایی قرار گرفت. 5 جدایه از BYMV در گروه bean Broad و جدایه دیگر در گروه General طبقه بندی شدند. همچنین ماتریکس تشابه نشان داد که جدایه ایرانی (SIB9 (BYMV به میزان 98 % مشابه با جدایه ژاپن بود. در حالیکه حداقل تشابه نوکلئوتیدی آن با یک جدایه از روی گالیول در هند به میزان 80% بود. بررسی نوترکیبی نشان داد که در 3 جدایه ایرانی از BYMV نوترکیبی اتفاق افتاده است. توالی نوکلئوتیدی یک جدایه ایرانی(SIB1 (TuMV تشابه ای به میزان 99 %در ناحیه پروتئین پوششی، با جدایه ای از چین را نشان داد. این تحقیق اولین گزارش پوتیویروسهای TuMV و BYMV بر روی گیاه ریحان از استان سیستان و بلوچستان و ایران می باشد.
پژوهشگران	ملک نواز شجاع (استاد مشاور)، فائزه السادات ابطحی (استاد مشاور)، سیده عاطفه حسینی (استاد راهنما)، محبوبه علیخانی (دانشجو)