عنوان
|
ارزیابی بیومدیکالی میزان بیان و متیلاسیون ژن TWIST1 در بافت توموری بیماران مبتلا به سرطان پستان
|
نوع پژوهش
|
پایان نامه های تقاضا محور و غیر تقاضا محور
|
کلیدواژهها
|
سرطان، متاستاز، گذر اپی تلیال- مزانشیم (EMT) ، TWIST1، فاکتور رونویسی، بیان ژن، متیلاسیون
|
چکیده
|
مقدمه: سرطان پستان شایع ترین سرطان در میان زنان جهان است. علت اصلی مرگ و میر های ناشی از سرطان ها، تهاجم و متاستاز آن به بافت های ثانویه است. یکی از فرآیند های مهم که نقش ضروری در ایجاد فنوتیپ تهاجمی در سلول های سرطانی دارد، فرآیند گذر اپی تلیال – مزانشیم (EMT) است. این فرآیند تحت کنترل فاکتورهای رونویسی مرتبط با EMT (EMT-TFs) است. یکی از مهمترین این فاکتورها، پروتئین TWIST1 است. این پروتئین به عنوان یک آنکوژن شناخته می شود، همچنین نقش مهمی در تهاجم و متاستاز، مهار آپاپتوز، رگ زایی و مقاومت دارویی دارد. هدف از این مطالعه بررسی میزان بیان TWIST1 در بافت توموری و سالم مجاور افراد مبتلا به سرطان پستان و نیز بررسی وضعیت متیلاسیون پروموتر این ژن و ارتباط آن با تغییرات بیان ژن و شاخص های بالینی و پاتولوژیکی بیماران می باشد. در این میان فاکتورهای رونویسی که دارای جایگاه شناسایی در توالی پروموتر این ژن هستند نیز بررسی شدند. مواد و روش ها: 30 بافت توموری پستان و 30 بافت سالم مجاور از همان بیماران به عنوان گروه کنترل انتخاب شدند. جهت بررسی میزان بیان از روش qPCR استفاده شد و تغییرات بیانی ژن، توسط روش Livak(2^(-∆∆ct)) مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. جهت بررسی وضعیت متیلاسیون پروموتر این ژن، از روش MSP استفاده شد و نتایج حاصل توسط آزمون آماری مَن ویتنی یو بررسی شدند و مقادیر 05/0 p=معنی دار در نظر گرفته شد. جهت شناسایی فاکتورهای رونویسی دارای جایگاه شناسایی روی توالی پروموتر این ژن و ارتباط آن با متیلاسیون، از روش های In-Silico استفاده شد. نتایج: نتایج آنالیز بیان ژن TWIST1 نشان دهنده ی افزایش بیان 2/2 برابری این ژن در گروه توموری می باشد (003/0p=). آنالیز وضعیت متیلاسیون پروموتر این ژن اختلاف بسیار معناداری را بین گروه سالم و توموری نشان می دهد (000/0P=) هیچ کدام از نمونه های سالم باند متیله را نشان نداده در حالی که (30/17) 66/56 از نمونه های توموری متیله مثبت گزارش شدند ارتباط معنا داری میان وضعیت متیلاسیون پروموتر و فاکتور p53 (049/0P=) و نیز بین میزان بیان TWIST1 و مرحله ی بیماری (022/0p=) مشاهده شد. 53 فاکتور رونویسی که دارای جایگاه شناسایی در توالی پروموتر TWIST1 بودند شناسایی شدند که از این میان 20 فاکتور ، توانایی شناسایی جایگاه متیله را دارند. نتیجه گیری: نتایج این پژوه
|
پژوهشگران
|
صدیقه خزاعلی (استاد مشاور)، میلاد پزشکی (دانشجو)، احمد همتا (استاد راهنما)
|