مقدمه: امروزه اهمیت بهره وری کارمندان سازمان ها در راستای رسیدن به اهداف کلان سازمانی، در نظر گرفتن سلامت سازمانی و افسردگی کارمندان توسط مدیران، موضوع مهم در بهره وری سازمانی است. در این راستا، هدف پژوهش حاضر، بررسی رابطه سلامت سازمانی و افسردگی با بهره وری کارمندان ادارات ورزش و جوانان استان اصفهان و ارائه مدل معادلات ساختاری بود. روش بررسی: این تحقیق از نوع توصیفی- تحلیلی بود که برای مدل سازی از رویکرد حداقل مربعات جزئی استفاده شد. ابزار پژوهش پرسشنامه های بهره وری هرسی و گلداسمیت (1980)، سلامت سازمانی هوی و فیلدمن (1996) و پرسشنامه افسردگی بِک (1961) بود. روایی پرسشنامه توسط متخصصان مورد تائید قرار گرفت و پایایی پرسشنامه ها مناسب به دست آمد. جامعه آماری شامل کارمندان ادارات ورزش و جوانان استان اصفهان بود (387 نفر) که نمونه آماری بر اساس تعداد عامل های پژوهش مبتنی بر رویکرد پی.ال. اس 90 نفر تعیین شد. 78 پرسش نامۀ کامل جمع آوری و بازگشت داده شد. از روش نمونه گیری تصادفی خوشه ای استفاده شد. یافته ها: نتایج نشان داد سلامت سازمانی بر بهره وری شغلی تأثیر مثبت و معناداری داشت (0/01≥p) ولی افسردگی بر بهره وری شغلی تأثیر منفی داشت ولی این تأثیر معنادار نبود. هم چنین افسردگی بر سلامت سازمانی تأثیر منفی داشت ولی این تأثیر معنادار نبود. نتیجه گیری: توانایی سازمان در حفظ و پایداری سازمانی و بهبود این توانایی، منجر به بهبود بهره وری کارمندان ادارات ورزش و جوانان می شود. در این راستا پیشنهاد می شود مدیران و سرپرستان سازمان های ورزشی در راستای بهبود سلامت سازمانی، بر اهمیت ارتباطات با و در بین کارمندان تأکید و بر موضوعات روان شناختی سازمانی در جهت بهبود بهره وری تأکید نمایند.