مقدمه: با توجه به اهمیت بکارگیری از آموزش الکترونیکی در دانشگاههای علوم پزشکی، پژوهش حاضر با هدف شناسایی و سطحبندی عوامل موثر بر کاربرد آموزش الکترونیکی در دانشگاه علوم پزشکی شهید صدوقی یزد بر اساس مدلسازی ساختاری تفسیری صورت گرفت. روش بررسی: روش پژوهش، مطالعه موردی و به منظور تجزیه و تحلیل داده ها از تکنیک مدلسازی ساختاری تفسیری جهت سطح بندی عوامل و دستهبندی آنها استفاده شد. مشارکت کنندگان پژوهش را اعضای هیات علمی دانشگاه علوم پزشکی شهید صدوقی یزد تشکیل می دادند که از بین آنها 11 نفر به عنوان متخصص در حوزه آموزش پزشکی انتخاب شدند. ابزار گردآوری دادهها، پرسشنامه محقق ساخته بود و روایی محتوایی آن توسط متخصصان آموزش پزشکی به تایید رسید. نتایج: نتایج پژوهش نشان داد که 15 عامل، از جمله زیر ساختهای فنی، اهداف مدون و مشخص آموزشی، مشوقهای آموزشی و پژوهشی، آگاهی و توانمندی اساتید، ساختارهای اجرایی- آموزشی، مدیریت نوآور و مدیران حمایتگر به عنوان عوامل موثر بر کاربرد آموزش الکترونیکی در دانشگاه علوم پزشکی به حساب میآیند. همچنین تحلیل سطحبندی عوامل نشان داد که این مدل دارای 9 سطح است که از عمیقترین و تاثیرگذارترین سطح به سطحیترین و تاثیرپذیرترین سطح عوامل موثر در اجرای یادگیری الکترونیکی در مدل نشان داده شده است. نتیجه گیری: از آنجائی که نگرش نوآورانه، زیرساختهای فنی، آییننامههای آموزشی، ساختارهای اجرایی- آموزشی که عمدتا در حوزه سیاستگذاری است به عنوان عوامل زیربنائی در بکارگیری آموزش الکترونیکی نقش ایفا میکنند، توصیه میشود سیاستگذاران و مدیران دانشگاههای علوم پزشکی در تسهیل این عوامل اقدام نمایند.