محمد حسین مرادی

انتخاب در جهت افزایش فراوانی جهشهای جدیدی که در برخی از جمعیتها مفید هستند باعث به جا گذاشتن نشانههایی در سطح ژنوم میشوند. در این مسیر انتخابهای انجام شده توسط انسان نشانههای قابل شناسایی را در ژنوم گاوهای امروزی به جا گذاشته که آشکارسازی این نشانهها میتواند به اصلاح و بهبود ژنتیکی صفات مهم اقتصادی در این حیوانات کمک کند. شناسایی نواحی کاندید برای صفات سلامت یکی از مهمترین و چالش- برانگیزترین تحقیقات برای درک مکانیسمهای مولکولی شامل سازگاری و همچنین شناسایی مناطق مرتبط با صفات مهم اقتصادی در گاوها میباشد. بیماری لکوز گاوی ( )BLVیکی از بیماریهای کشنده ویروسی است که هر ساله با هزینههای قابل توجهای برای کنترل و ریشهکنی و ضررهای اقتصادی زیادی در صنعت گاو شیری، همانند کاهش توان تولیدی و عملکرد تولیدمثلی حیوانات مبتلا و نهایتا حذف آنها همراه است. در این تحقیق با هدف شناسایی مناطق ژنومی مرتبط با لکوز گاوی ( ،)BLVاز اطلاعات پروژه تعیین ژنوتیپ گاوهای ماده برتر نژاد هلشتاین شرکت فکای اصفهان استفاده شد. در این پروژه تعیین ژنوتیپ 145رأس گاو هلشتاین ( 77رأس بیمار و 68رأس سالم) با استفاده از آرایههای شرکت ایلومینا، )GGP Bovine LD v4 30k( GeneSeekانجام شد. آنالیزهای آماری با استفاده از آمارههای مختلف شامل روشهای مبتنی بر تمایز و الگوی تنوع ژنتیکی ()FST و عدم تعادل پیوستگی ( iHS ،EHHو )XP-EHHانجام شدند. با استفاده از آزمون ،FSTچهار منطقه ژنـومی روی کروموزومهای 20 ،13 ،1و 22که ارزش تتای آنها بالاتر از 0/1درصد حد بالای توزیع تجربی تتا بود به عنوان مناطق کاندیدای انتخاب شناسایی شدند. نتایج نشان میدهد که وقتی از آماره iHSبرای بررسی ردپای انتخاب برای مقاومت به بیماری لکوز در گاو هلشتاین استفاده شد مناطق مورد انتخاب برای دامهای سالم در کروموزومهای شماره 22 ،10 ،6 ،5 ،3و همچنین برای دامهای مبتلا به لکوز در کروموزومهای 10 ،4 ،3و 20 بوده است. بر روی کروموزوم ،3در گاو سالم CAPZA1 ،CD53و PROK1و در گاو بیمار ژن ،CAPZA1بر TFEC ،HBP1 ،DUS4L ،COG5 ،HBP1 ،CBLL1 ،ST7 ،CFTR ،CAV2 ،MET ژن4 روی کروموزوم ، در کروموزومHSD17B6 وLOC101902542 ،R3HDM2 ،SYN3 ژنهای5 ، در کروموزومBCAP29 و 6ژن ،SLIT2در کروموزوم 10ژن در گاوهای سالم CYP19A1و در گاوهای مبتلا ،SCG5بر روی کروموزوم 13نیز ژن ،BNMT3Bدر کروموزوم ،20دو ژ