گوسفند اهلی یک گونه دامی و منبع مهم پروتئینی در جهان است وکه ایران یکی از مهم ترین مراکز پرورش گوسفند در دنیا محسوب می شودمی باشد. هدف از این تحقیقدر این مطالعه، شناسایی مانشانه های انتخاب در بین دو نژاد گوسفند ایرانی بلوچی و لری بختیاری را با استفاده از آرایه های ژنومی Illumina ovine SNP50 BeadChip بود شناسایی نمودیم که امکان تعیین ژنوتیپ با حدود 50000 جایگاه نشانگری SNP در سطح ژنوم گوسفند را فراهم می کندتعیین ژنوتیپ شدند. جهت جستجوی نشانه های انتخاب از آزمونبرآوردگر نااریب FST ویر و کوکرهام (تتا) تتا استفاده شد. در مجموع در این تحقیق 21 منطقه ژنومی شامل صدک بالای 001/0 سیگنال ها با استفاده از OARv3.1 ovisariesبر روی کروموزوم های1، 2، 3، 4، 5، 8، 10، 12، 13، 16، 18 و X با تمایز جمعیتی بالا بین این دو نژاد شناسایی شدمشخص شد. بررسی بیشتر این مناطق نشان داد که تمام این جایگاه ها در نهایت، نشانه های انتخاب ویژه شناسایی شدند که نشان دهنده انتخاب طبیعی و مصنوعی برایبا ژن های دخیل در صفات تولید مثلی، سیتولوژی سلولی، سیستم های عصبی، ایمنی و ماهیچه ای(رشد) در ارتباط هستندبود. نتایج این تحقیق می تواندمطالعه امکان تعیین ژن های کاندید عملکردی تحت انتخاب مثبت را برای استفاده در پژوهش های ژنتیک و اصلاح نژاد آینده در نژادهای گوسفند ایرانی فراهم می آورد.