محمد حسین مرادی

هدف از تحقیق حاضر، بررسی ساختار ژنتیکی ماهیان کپور معمولی وحشی (دریایی) و پرورشی با استفاده از روش 2b RAD-Seq بود. به این منظور از 49 قطعه ماهی شامل 21 ماهی کپور معمولی وحشی و 28 ماهی کپور معمولی پرورشی نمونه‌گیری شد. از باله دمی ماهیان جهت استخراج DNA، نمونه‌گیری به عمل آمد. کتابخانه ژنومی با استفاده از روش 2b RAD تهیه شد. بعد از کنترل کیفی اولیه با استفاده از نرم‌افزار STACKS تعداد 82645 نشانگر شناسایی شد. در نهایت، از این تعداد حدود 64645 نشانگر از مراحل مختلف کنترل کیفی عبور کردند و در آنالیزهای بعدی مورد استفاده قرار گرفتند. جهت بررسی ساختار ژنتیکی جمعیت‌ها، آنالیز تجزیه به مؤلفه‌ها اصلی (PCA) انجام شد. نتایج نشان داد که مؤلفه اصلی PC1 دو ماهی کپور معمولی وحشی و پرورشی را از هم جدا می‌کند و همه جمعیت‌های کپور معمولی پرورشی نیز در PCهای بعدی از یکدیگر تفکیک می‌شوند. در این تحقیق، PC1، PC2 و PC3 به ترتیب 23، 22 و 13 درصد از کل واریانس را به خود اختصاص دادند.