انتخاب طبیعی و مصنوعی نقش های حیاتی در اهلی سازی و شکل دادن به تنوع ژنتیکی نژادهای مختلف گوسفند بازی می کند. ایران نژادهای گوسفند بومی متعددی با ویژگی های متفاوت در مورفولوژی و عملکرد تولید دارد. هدف از این پژوهش بررسی نشانه های انتخاب در سطح ژنوم دو نژاد شاخص گوسفند ایرانی بلوچی و زل از طریق توصیف ساختار عدم تعادل لینکاژی با استفاده از آرایه های ژنومیIllumina ovine SNP50 BeadChip می باشد. در این تحقیق عدم تعادل لینکاژی برای هر مکان ژنی بین نژاد بلوچی و زل با استفاده از روش XP-EHH اندازه گیری گردید. نتایج حاصل باعث شناسایی 13 منطقه ژنومی بر روی کروموزوم های 1، 10، 13، 14، 25 و X شد. تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیک نشان داد که بعضی ژن ها در این مناطق تحت انتخاب با صفات توسعه سیستم ایمنی، عصبی، توسعه سیستم اسکلتی و اندام و تمایز سلول های چربی مربوط هستند. در نهایت، یافته ما یک نگاه اجمالی به انتخاب های متنوع ژنومی در طول اهلی سازی و تشکیل نژادهای گوسفند ارائه می دهد که می تواند در جهت بهبود عملکرد تولید دو گوسفند بومی ایران استفاده گردد.
