آلودگی ناشی از میکرو ارگانیسم ها مهم ترین دلیل تلفات حین کشت درون شیشه ای گیاهان است و استفرار یک کشت موفق مستلزم حذف آلودگی درون زاد و بیرون زاد است. با شناسایی انواع آلودگی های احتمالی در کشت درون شیشه ای گیاهان و آشنایی با انواع روش های علمی و کاربردی در برطرف کردن آن ها می توان از صرف هزینه های زیاد در مراحل ابتدایی پروژه های کشت سلول و بافت گیاهان جلوگیری کرد. فرآیند تولید تجاری گیاهان عاری از پاتوژن باید تسریع شود تا مقرون به صرفه باشد.ایجاد شرایط سترون و تولید گیاهان عاری از پاتوژن کلیدی طلایی برای فعالیت این حوزه است.
