1404/09/14
امیر حسین خلت آبادی فراهانی

امیر حسین خلت آبادی فراهانی

مرتبه علمی: دانشیار
ارکید: https://orcid.org/0000-0001-5805-590X
تحصیلات: دکترای تخصصی
شاخص H:
دانشکده: دانشکده کشاورزی و محیط زیست
اسکولار:
پست الکترونیکی: a-farahani [at] araku.ac.ir
اسکاپوس: مشاهده
تلفن:
ریسرچ گیت:

مشخصات پژوهش

عنوان
مقایسه ژنومی نژادهای گوسفند شیری کایاس و فریزارته از نظر شمار سلول‌های بدنی شیر با استفاده از روش‌های برآوردگر نااریب FST و hapFLK
نوع پژوهش
مقاله چاپ‌شده
کلیدواژه‌ها
آزمون hapFLK آماره FST ژن کاندیدا گوسفند شیری ورم پستان
سال 1403
مجله تحقیقات تولیدات دامی
شناسه DOI
پژوهشگران حسین محمدی ، امیر حسین خلت آبادی فراهانی

چکیده

از شمار سلول‌های بدنی به­عنوان روشی غیرمستقیم برای کنترل ورم پستان استفاده می‌شود. هدف این پژوهش، مقایسه ژنومی دو نژاد گوسفند شیری کایاس و فریزارته از نظر شمار سلول‌های بدنی شیر بود. برای این منظور از اطلاعات ژنوتیپی 587 رأس دام با کمترین خویشاوندی و تعیین ژنوتیپ شده با آرایه­های50K گوسفندی استفاده شد. برای شناسایی مناطق ژنومی از دو آزمون آماری برآوردگر نااریب FST و hapFLK استفاده شد. ژن‌های کاندیدا با استفاده از SNP­هایی که در بازه‌ 01/0 درصد ارزش بالای این دو آزمون واقع‌ شده بودند شناسایی شدند. نتایج حاصل از آماره تتا به شناسایی نه ناحیه ژنومی روی کروموزوم­های 2، 5، 7، 10، 11، 13 (دو ناحیه)، 17 و 22 منجر شد. ژن­های کاندیدای شناسایی شده شامل ژن­های IL11RA،CDC16 ،CARD14، BTRC،OTUD4 ، COL23A1، LACTB و PRELID3B بودند و عملکردهای متفاوتی با سیستم ایمنی، پاسخ ایمنی ذاتی، پاسخ التهابی، سرطان و تولید شیر داشتند. نتایج حاصل از آماره hapFLK به شناسایی شش ناحیه ژنومی روی کروموزوم­های 3، 4، 5، 7، 10 و 13 منجر شد. ژن­های کاندیدای شناسایی شده شامل FAM49A، CDK6 و DLGAP5 بودند و عملکردهای متفاوتی در ایمنی ذاتی و انواع سرطان داشتند. با توجه به اینکه تحقیقات اندکی در رابطه با شمار سلول‌های بدنی شیر در گوسفندان نژاد شیری انجام شده است، نتایج این تحقیق می‌تواند اطلاعات ارزشمندی در رابطه با شمار سلول‌های بدنی شیر ارایه دهد. به هر حال، به­منظور درک بهتر ژن‌های مؤثر بر این صفت مهم ضروری است پژوهش‌های گسترده‌تر با تعداد نمونه‌های بیشتری انجام شود.